More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3339 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  100 
 
 
732 aa  1406    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  43.81 
 
 
741 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  42.6 
 
 
704 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.24 
 
 
842 aa  260  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.72 
 
 
717 aa  240  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  35.01 
 
 
832 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.48 
 
 
743 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.98 
 
 
723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.77 
 
 
983 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.77 
 
 
983 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.89 
 
 
758 aa  220  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.96 
 
 
979 aa  220  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.67 
 
 
978 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.5 
 
 
735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.37 
 
 
736 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.1 
 
 
717 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.62 
 
 
740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  31.29 
 
 
770 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  29.45 
 
 
733 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.82 
 
 
735 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.47 
 
 
724 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.55 
 
 
704 aa  213  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  33.69 
 
 
737 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 
715 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  35.15 
 
 
752 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.4 
 
 
966 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  32.13 
 
 
738 aa  211  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.73 
 
 
766 aa  211  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.2 
 
 
968 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 
761 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  33.72 
 
 
758 aa  207  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.13 
 
 
745 aa  206  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.18 
 
 
743 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  30.51 
 
 
920 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  30 
 
 
738 aa  205  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.95 
 
 
731 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.52 
 
 
740 aa  204  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  31.03 
 
 
730 aa  203  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  32.81 
 
 
751 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  34.62 
 
 
737 aa  203  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  31.27 
 
 
730 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.93 
 
 
723 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.18 
 
 
1155 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.14 
 
 
758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.73 
 
 
729 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.85 
 
 
730 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.94 
 
 
732 aa  201  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31.02 
 
 
740 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.08 
 
 
734 aa  201  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  33.51 
 
 
755 aa  200  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  30.73 
 
 
730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.67 
 
 
730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  30.73 
 
 
730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  34.57 
 
 
738 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.67 
 
 
743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  30.73 
 
 
730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  31.52 
 
 
787 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  30.55 
 
 
730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.39 
 
 
737 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  30.18 
 
 
730 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  34.21 
 
 
731 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  31.98 
 
 
769 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  31.98 
 
 
769 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.76 
 
 
711 aa  197  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.51 
 
 
718 aa  197  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.66 
 
 
761 aa  196  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  30.55 
 
 
730 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.95 
 
 
728 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.47 
 
 
738 aa  195  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.71 
 
 
749 aa  195  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  32.91 
 
 
748 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  32.91 
 
 
754 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  30.21 
 
 
1002 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.29 
 
 
709 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.39 
 
 
760 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.1 
 
 
781 aa  190  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  28.36 
 
 
909 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  32.66 
 
 
796 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  28.4 
 
 
742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  34.66 
 
 
731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  31.71 
 
 
805 aa  184  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.22 
 
 
750 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  30.18 
 
 
917 aa  184  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  29.89 
 
 
732 aa  184  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.06 
 
 
846 aa  183  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.52 
 
 
743 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  33.27 
 
 
903 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.29 
 
 
741 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.35 
 
 
714 aa  180  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.16 
 
 
710 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.08 
 
 
727 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.09 
 
 
741 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  31.49 
 
 
839 aa  178  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.86 
 
 
724 aa  178  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.78 
 
 
876 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.21 
 
 
726 aa  177  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  29.13 
 
 
793 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  29.7 
 
 
734 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.33 
 
 
829 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  30.15 
 
 
778 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>