More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  52.93 
 
 		 757 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  59.21 
 
 		 743 aa  764    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  50.79 
 
 		 738 aa  658    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 761 aa  1467    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  39.26 
 
 		 733 aa  364  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.97 
 
 		 740 aa  356  8.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  35.64 
 
 		 766 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  38.11 
 
 		 740 aa  336  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  39.6 
 
 		 758 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.33 
 
 		 710 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  36.92 
 
 		 738 aa  326  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  33.82 
 
 		 770 aa  321  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 1155 aa  320  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  34.71 
 
 		 736 aa  313  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  34.45 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  36.66 
 
 		 731 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  36.63 
 
 		 731 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.66 
 
 		 724 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  37.31 
 
 		 751 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  36.44 
 
 		 762 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  37.58 
 
 		 805 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  36.39 
 
 		 769 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  36.39 
 
 		 769 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.36 
 
 		 717 aa  297  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  34.51 
 
 		 738 aa  296  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.75 
 
 		 1308 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.5 
 
 		 743 aa  290  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  36.84 
 
 		 767 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  36.84 
 
 		 767 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.56 
 
 		 709 aa  286  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  33.88 
 
 		 748 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  33.88 
 
 		 754 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  36.68 
 
 		 767 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  36.96 
 
 		 727 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.28 
 
 		 740 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  36.44 
 
 		 796 aa  283  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  32.85 
 
 		 839 aa  282  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  34.76 
 
 		 778 aa  271  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 846 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  33.72 
 
 		 783 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.08 
 
 		 944 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.15 
 
 		 1095 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  32.05 
 
 		 738 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.96 
 
 		 1013 aa  259  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  31.18 
 
 		 730 aa  257  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.3 
 
 		 997 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.54 
 
 		 741 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  31.07 
 
 		 730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  30.91 
 
 		 730 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.83 
 
 		 730 aa  253  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.73 
 
 		 730 aa  250  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.56 
 
 		 737 aa  250  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.56 
 
 		 730 aa  250  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.7 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.16 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.16 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.16 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.35 
 
 		 729 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  32.31 
 
 		 953 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.42 
 
 		 704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  37.97 
 
 		 723 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  41.53 
 
 		 773 aa  241  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.38 
 
 		 732 aa  240  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.34 
 
 		 829 aa  234  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.34 
 
 		 829 aa  234  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 717 aa  234  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.46 
 
 		 743 aa  228  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  33.91 
 
 		 734 aa  228  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.93 
 
 		 983 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.95 
 
 		 715 aa  226  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.93 
 
 		 983 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  28.89 
 
 		 737 aa  226  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.93 
 
 		 979 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  34.42 
 
 		 876 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  33.75 
 
 		 793 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  33.94 
 
 		 734 aa  226  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.16 
 
 		 743 aa  226  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.59 
 
 		 749 aa  225  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.7 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.48 
 
 		 745 aa  220  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.64 
 
 		 978 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.42 
 
 		 735 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  33.64 
 
 		 728 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  34.45 
 
 		 832 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.48 
 
 		 724 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  35.45 
 
 		 758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  29.34 
 
 		 779 aa  217  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31 
 
 		 718 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  35.18 
 
 		 731 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  33.39 
 
 		 787 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  32.93 
 
 		 794 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  30.52 
 
 		 735 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  33.23 
 
 		 745 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.17 
 
 		 729 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.07 
 
 		 751 aa  210  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.48 
 
 		 842 aa  210  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.9 
 
 		 741 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  33.22 
 
 		 735 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  33.95 
 
 		 704 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>