More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4481 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 1095 aa  2183    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  44.83 
 
 		 997 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  52.39 
 
 		 1013 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  49.52 
 
 		 944 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  41.12 
 
 		 710 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  49.02 
 
 		 632 aa  499  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  52.86 
 
 		 1110 aa  426  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  36.41 
 
 		 766 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  49 
 
 		 1093 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  49 
 
 		 1093 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  48.8 
 
 		 1089 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  35.7 
 
 		 733 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 740 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  33.55 
 
 		 738 aa  357  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.35 
 
 		 805 aa  349  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  33.66 
 
 		 731 aa  343  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.81 
 
 		 1308 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  33.93 
 
 		 717 aa  341  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 		 796 aa  337  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  32.01 
 
 		 743 aa  330  9e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.71 
 
 		 770 aa  329  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.84 
 
 		 727 aa  328  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 1155 aa  327  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.6 
 
 		 741 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  34.98 
 
 		 783 aa  303  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  30.91 
 
 		 751 aa  301  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  34.1 
 
 		 762 aa  299  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.58 
 
 		 769 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.58 
 
 		 769 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  31.42 
 
 		 738 aa  298  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.49 
 
 		 736 aa  291  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  29.09 
 
 		 754 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  29.09 
 
 		 748 aa  288  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.32 
 
 		 758 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 773 aa  276  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.73 
 
 		 724 aa  274  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 778 aa  273  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  28.07 
 
 		 767 aa  268  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  28.05 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  28.05 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  28.36 
 
 		 953 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  30.65 
 
 		 738 aa  256  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 		 731 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.22 
 
 		 730 aa  255  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.09 
 
 		 730 aa  254  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.09 
 
 		 730 aa  254  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.09 
 
 		 730 aa  254  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  30.22 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.78 
 
 		 757 aa  252  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.84 
 
 		 730 aa  251  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.33 
 
 		 730 aa  251  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.74 
 
 		 730 aa  250  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  31.15 
 
 		 761 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.85 
 
 		 738 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  30.47 
 
 		 743 aa  249  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.62 
 
 		 730 aa  247  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.82 
 
 		 730 aa  244  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.77 
 
 		 740 aa  244  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5546  RND superfamily drug efflux protein  54.26 
 
 		 243 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0356302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.85 
 
 		 717 aa  237  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.55 
 
 		 741 aa  237  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.28 
 
 		 729 aa  234  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  29.01 
 
 		 839 aa  232  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 846 aa  224  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.34 
 
 		 740 aa  224  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  27.95 
 
 		 735 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.73 
 
 		 779 aa  218  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.62 
 
 		 718 aa  218  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.59 
 
 		 979 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.26 
 
 		 983 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.26 
 
 		 983 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.48 
 
 		 750 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.93 
 
 		 740 aa  214  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.48 
 
 		 743 aa  209  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.92 
 
 		 737 aa  208  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.43 
 
 		 734 aa  206  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.47 
 
 		 745 aa  205  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  30.21 
 
 		 709 aa  204  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  27.63 
 
 		 735 aa  204  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.82 
 
 		 724 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.95 
 
 		 1382 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  27.72 
 
 		 743 aa  200  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  27.4 
 
 		 966 aa  197  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.71 
 
 		 829 aa  197  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.71 
 
 		 829 aa  197  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.45 
 
 		 704 aa  196  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.42 
 
 		 714 aa  195  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  27.45 
 
 		 968 aa  194  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.97 
 
 		 749 aa  194  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.76 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  26.67 
 
 		 842 aa  191  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  28.49 
 
 		 787 aa  190  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.33 
 
 		 736 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.47 
 
 		 723 aa  189  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  26.6 
 
 		 978 aa  189  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.59 
 
 		 752 aa  188  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 		 711 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  29.25 
 
 		 761 aa  188  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  28.73 
 
 		 779 aa  185  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  30.51 
 
 		 758 aa  184  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>