More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0180 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  100 
 
 		 1093 aa  2187    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  100 
 
 		 1093 aa  2187    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  69.7 
 
 		 1013 aa  827    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  98.81 
 
 		 1089 aa  2025    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  72.55 
 
 		 1110 aa  1538    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  56.49 
 
 		 944 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  60.23 
 
 		 632 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  46.59 
 
 		 1095 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  47.79 
 
 		 997 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  43.73 
 
 		 710 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5546  RND superfamily drug efflux protein  69.34 
 
 		 243 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0356302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  35.64 
 
 		 766 aa  222  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.83 
 
 		 740 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  35.36 
 
 		 733 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  34.21 
 
 		 796 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  33.42 
 
 		 741 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.23 
 
 		 758 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.46 
 
 		 770 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.11 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.4 
 
 		 724 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.37 
 
 		 717 aa  194  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  32.17 
 
 		 727 aa  190  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  31.54 
 
 		 783 aa  186  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.24 
 
 		 757 aa  185  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.77 
 
 		 1308 aa  185  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  31.14 
 
 		 751 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 738 aa  184  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  32.34 
 
 		 743 aa  182  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.97 
 
 		 805 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.07 
 
 		 743 aa  181  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.1 
 
 		 769 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.1 
 
 		 769 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.06 
 
 		 738 aa  177  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  32.28 
 
 		 738 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.06 
 
 		 731 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.99 
 
 		 736 aa  172  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.58 
 
 		 761 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  41.11 
 
 		 762 aa  171  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  30.64 
 
 		 778 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  31.32 
 
 		 748 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  31.32 
 
 		 754 aa  168  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.14 
 
 		 1155 aa  166  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.35 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.84 
 
 		 730 aa  161  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.3 
 
 		 730 aa  160  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.84 
 
 		 730 aa  160  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.84 
 
 		 730 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.84 
 
 		 730 aa  160  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.84 
 
 		 730 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.84 
 
 		 730 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  30.87 
 
 		 839 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  37.9 
 
 		 500 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.84 
 
 		 730 aa  159  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.58 
 
 		 730 aa  159  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.6 
 
 		 758 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.12 
 
 		 724 aa  157  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  32.34 
 
 		 767 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  32.34 
 
 		 767 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  29.57 
 
 		 738 aa  153  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.51 
 
 		 735 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  40.38 
 
 		 814 aa  152  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.6 
 
 		 718 aa  152  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  31.45 
 
 		 767 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  29.43 
 
 		 731 aa  150  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  39.57 
 
 		 723 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 743 aa  149  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30.88 
 
 		 842 aa  148  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  36.82 
 
 		 735 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  38.65 
 
 		 735 aa  147  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.08 
 
 		 740 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.46 
 
 		 735 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  30.56 
 
 		 743 aa  144  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  28.78 
 
 		 779 aa  144  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.09 
 
 		 740 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.21 
 
 		 740 aa  142  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  35.84 
 
 		 787 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  30.37 
 
 		 953 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.58 
 
 		 729 aa  142  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  35.59 
 
 		 841 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.44 
 
 		 829 aa  142  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.44 
 
 		 829 aa  142  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.47 
 
 		 729 aa  141  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.97 
 
 		 726 aa  140  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.5 
 
 		 741 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  40 
 
 		 773 aa  138  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 846 aa  138  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.71 
 
 		 760 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.13 
 
 		 779 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.35 
 
 		 1382 aa  135  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.24 
 
 		 752 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.32 
 
 		 737 aa  134  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  28.78 
 
 		 758 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.03 
 
 		 728 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  29.95 
 
 		 711 aa  132  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.1 
 
 		 723 aa  132  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.91 
 
 		 749 aa  131  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  32.62 
 
 		 715 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  27.85 
 
 		 734 aa  130  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.43 
 
 		 737 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>