More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1227 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  100 
 
 		 814 aa  1599    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  32.55 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  33.41 
 
 		 783 aa  318  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  35.15 
 
 		 758 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 741 aa  245  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.76 
 
 		 796 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.72 
 
 		 1308 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  48.39 
 
 		 733 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  32.24 
 
 		 730 aa  228  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  32.46 
 
 		 730 aa  226  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  31.37 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  31.6 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  31.59 
 
 		 730 aa  223  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  31.15 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  31.15 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  31.15 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  31.15 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  45.68 
 
 		 766 aa  220  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  31.37 
 
 		 730 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31.8 
 
 		 740 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  43.79 
 
 		 717 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  44.83 
 
 		 846 aa  203  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  44.27 
 
 		 738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  45.73 
 
 		 796 aa  202  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  48.33 
 
 		 724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  44.92 
 
 		 770 aa  195  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  33.94 
 
 		 731 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.06 
 
 		 737 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31 
 
 		 710 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  31.57 
 
 		 738 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  44.98 
 
 		 740 aa  190  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.69 
 
 		 738 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  46.36 
 
 		 757 aa  185  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  42.62 
 
 		 727 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  46.82 
 
 		 743 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  33.49 
 
 		 741 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 		 734 aa  184  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  41.28 
 
 		 754 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.44 
 
 		 1155 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  45.85 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  41.28 
 
 		 748 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  40.95 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  45.33 
 
 		 736 aa  182  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  42.8 
 
 		 717 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  39.75 
 
 		 778 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  40.09 
 
 		 751 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  41.57 
 
 		 724 aa  181  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  44.4 
 
 		 762 aa  181  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  36.22 
 
 		 731 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  44.65 
 
 		 743 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  44.98 
 
 		 773 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  41.31 
 
 		 1013 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  43.46 
 
 		 1110 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  48.84 
 
 		 761 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  44.83 
 
 		 876 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  43.64 
 
 		 839 aa  174  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  37.6 
 
 		 769 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  37.6 
 
 		 769 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  41.41 
 
 		 743 aa  173  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  39.76 
 
 		 718 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  44.4 
 
 		 732 aa  171  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  41.56 
 
 		 978 aa  170  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  39.39 
 
 		 500 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.82 
 
 		 726 aa  168  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  41.99 
 
 		 979 aa  168  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  42.45 
 
 		 745 aa  168  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  41.99 
 
 		 983 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  41.99 
 
 		 983 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  45.83 
 
 		 745 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  46.75 
 
 		 743 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  40.6 
 
 		 968 aa  164  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  39.66 
 
 		 723 aa  164  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  39.73 
 
 		 767 aa  164  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  39.73 
 
 		 767 aa  164  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  39.73 
 
 		 767 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  35.56 
 
 		 997 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.4 
 
 		 842 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  44.56 
 
 		 966 aa  161  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  39.22 
 
 		 735 aa  160  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  46.15 
 
 		 743 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.72 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  43.16 
 
 		 751 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  40.87 
 
 		 841 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  38.3 
 
 		 723 aa  159  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  40.93 
 
 		 944 aa  159  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.44 
 
 		 1095 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  38.36 
 
 		 735 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  37.66 
 
 		 743 aa  157  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  37.13 
 
 		 741 aa  157  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.06 
 
 		 709 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.82 
 
 		 729 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  37.08 
 
 		 854 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  40.25 
 
 		 917 aa  155  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  40.38 
 
 		 1093 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  40.38 
 
 		 1093 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  46.97 
 
 		 751 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  40.38 
 
 		 1089 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  35.63 
 
 		 772 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  35.63 
 
 		 772 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  40.5 
 
 		 737 aa  153  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>