More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0456 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  72.29 
 
 		 1093 aa  1520    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  72.29 
 
 		 1093 aa  1520    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  79.94 
 
 		 1013 aa  957    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  73 
 
 		 1089 aa  1532    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  100 
 
 		 1110 aa  2217    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  55.49 
 
 		 944 aa  612  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.32 
 
 		 1095 aa  443  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  59.94 
 
 		 632 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  48.19 
 
 		 997 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  42.71 
 
 		 710 aa  281  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5546  RND superfamily drug efflux protein  75.69 
 
 		 243 aa  267  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0356302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 766 aa  225  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  36 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  34 
 
 		 740 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  33.16 
 
 		 717 aa  198  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.51 
 
 		 770 aa  194  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 796 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.81 
 
 		 758 aa  191  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.72 
 
 		 741 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.52 
 
 		 1308 aa  191  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.71 
 
 		 757 aa  185  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  31.26 
 
 		 738 aa  184  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.13 
 
 		 731 aa  183  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.65 
 
 		 727 aa  182  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  38.37 
 
 		 743 aa  180  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.55 
 
 		 724 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  29.85 
 
 		 751 aa  177  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.97 
 
 		 805 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  28.61 
 
 		 769 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  28.61 
 
 		 769 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  28.04 
 
 		 783 aa  173  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  42.37 
 
 		 736 aa  173  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.05 
 
 		 761 aa  173  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.24 
 
 		 738 aa  172  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.89 
 
 		 717 aa  172  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  39.39 
 
 		 762 aa  172  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  32.11 
 
 		 730 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  30.56 
 
 		 761 aa  168  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  31.84 
 
 		 730 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  30.02 
 
 		 778 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  32.2 
 
 		 738 aa  166  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.9 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.79 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.9 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.9 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  31.58 
 
 		 730 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  31.05 
 
 		 730 aa  164  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  31.05 
 
 		 730 aa  164  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.97 
 
 		 730 aa  163  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  37.89 
 
 		 743 aa  163  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.91 
 
 		 1155 aa  162  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  29.13 
 
 		 748 aa  161  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  29.13 
 
 		 754 aa  161  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  43.46 
 
 		 814 aa  157  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.91 
 
 		 718 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  31.41 
 
 		 839 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.89 
 
 		 724 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  38.64 
 
 		 735 aa  154  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  35.48 
 
 		 500 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  38.07 
 
 		 735 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  38.53 
 
 		 723 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  29.47 
 
 		 729 aa  151  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  32.05 
 
 		 767 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  32.05 
 
 		 767 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 738 aa  150  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.88 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  31.75 
 
 		 767 aa  148  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.24 
 
 		 743 aa  148  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.63 
 
 		 740 aa  147  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.46 
 
 		 740 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  30.23 
 
 		 731 aa  146  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.61 
 
 		 741 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  31.4 
 
 		 953 aa  142  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 		 829 aa  141  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 		 829 aa  141  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  35.65 
 
 		 841 aa  141  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30 
 
 		 842 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.85 
 
 		 1382 aa  140  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 846 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.36 
 
 		 723 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.56 
 
 		 735 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  30.48 
 
 		 743 aa  138  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.96 
 
 		 729 aa  138  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  30.43 
 
 		 779 aa  138  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  40.87 
 
 		 773 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.4 
 
 		 737 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.26 
 
 		 726 aa  134  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  33.8 
 
 		 737 aa  134  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  28.98 
 
 		 779 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.26 
 
 		 758 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.78 
 
 		 760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.15 
 
 		 749 aa  133  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  33.78 
 
 		 787 aa  131  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.19 
 
 		 735 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  31.63 
 
 		 715 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  33.13 
 
 		 1002 aa  129  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.1 
 
 		 787 aa  128  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  37.08 
 
 		 724 aa  128  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.64 
 
 		 740 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  28.25 
 
 		 728 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>