More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1420 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  88.03 
 
 		 761 aa  1097    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 743 aa  1423    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  41.93 
 
 		 743 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  39.97 
 
 		 740 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  40.8 
 
 		 729 aa  452  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  41.39 
 
 		 737 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  40.08 
 
 		 758 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  40.38 
 
 		 842 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  39.74 
 
 		 750 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  39.55 
 
 		 876 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  39.89 
 
 		 752 aa  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  39.09 
 
 		 735 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  40.73 
 
 		 723 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.11 
 
 		 735 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.47 
 
 		 829 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.47 
 
 		 829 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.16 
 
 		 732 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  40.03 
 
 		 751 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  38.21 
 
 		 717 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  40.52 
 
 		 731 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  41.51 
 
 		 723 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  38.49 
 
 		 715 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  40.36 
 
 		 832 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.82 
 
 		 893 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.6 
 
 		 718 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  37.3 
 
 		 735 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.28 
 
 		 735 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.6 
 
 		 760 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  39.59 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  38.65 
 
 		 728 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.33 
 
 		 711 aa  376  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.48 
 
 		 749 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.28 
 
 		 726 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  35.75 
 
 		 779 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.55 
 
 		 796 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.35 
 
 		 724 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  38.68 
 
 		 793 aa  369  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.54 
 
 		 734 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.36 
 
 		 742 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  37.17 
 
 		 787 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  35.36 
 
 		 920 aa  362  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  36.1 
 
 		 781 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 		 772 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  35.71 
 
 		 772 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 		 772 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  37.03 
 
 		 732 aa  357  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  36.01 
 
 		 737 aa  349  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  38.39 
 
 		 724 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  36.38 
 
 		 909 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  36.49 
 
 		 917 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  30.64 
 
 		 704 aa  339  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  37.84 
 
 		 755 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  38.68 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  36.61 
 
 		 787 aa  334  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  35.81 
 
 		 779 aa  331  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.99 
 
 		 1002 aa  325  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.29 
 
 		 1382 aa  323  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  37.76 
 
 		 903 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.03 
 
 		 746 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  34.62 
 
 		 741 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.24 
 
 		 758 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  35.62 
 
 		 1058 aa  313  7.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  35.99 
 
 		 958 aa  310  9e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  35.34 
 
 		 734 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  35.47 
 
 		 784 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.76 
 
 		 791 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31.2 
 
 		 740 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  36.01 
 
 		 978 aa  297  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  38.39 
 
 		 1092 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  35.96 
 
 		 843 aa  290  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.19 
 
 		 737 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.71 
 
 		 979 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.71 
 
 		 983 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.71 
 
 		 983 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 846 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.01 
 
 		 854 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.22 
 
 		 717 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  36.12 
 
 		 968 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  38.11 
 
 		 903 aa  283  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  50.27 
 
 		 776 aa  283  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  34.49 
 
 		 733 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.79 
 
 		 743 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  35.1 
 
 		 807 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  35.35 
 
 		 732 aa  275  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  35.26 
 
 		 840 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.73 
 
 		 745 aa  271  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.37 
 
 		 738 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  35.33 
 
 		 734 aa  271  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.8 
 
 		 805 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  31.75 
 
 		 766 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  34.39 
 
 		 729 aa  266  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 736 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  35.03 
 
 		 966 aa  265  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  36 
 
 		 741 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  34.63 
 
 		 751 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.84 
 
 		 758 aa  253  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.53 
 
 		 710 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  34.74 
 
 		 737 aa  251  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.31 
 
 		 1308 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  35.27 
 
 		 751 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>