More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2172 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  53.13 
 
 		 787 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  53.75 
 
 		 779 aa  721    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  51.92 
 
 		 772 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 784 aa  1538    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  51.92 
 
 		 772 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  52.06 
 
 		 772 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  43.55 
 
 		 832 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  44.77 
 
 		 755 aa  529  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  41.98 
 
 		 728 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  43.49 
 
 		 735 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  41.61 
 
 		 734 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  42.75 
 
 		 731 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.5 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  43.23 
 
 		 791 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  40.45 
 
 		 737 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  40.83 
 
 		 854 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  40.91 
 
 		 735 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  42.82 
 
 		 723 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  41.08 
 
 		 840 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 		 843 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 793 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  43.07 
 
 		 958 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  37.96 
 
 		 920 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 734 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  38.34 
 
 		 779 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  39.14 
 
 		 787 aa  452  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  38.59 
 
 		 732 aa  452  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  36.96 
 
 		 917 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  47.15 
 
 		 1092 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  39.17 
 
 		 909 aa  442  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.04 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.04 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  39.56 
 
 		 1002 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.67 
 
 		 893 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  41.72 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  40.05 
 
 		 729 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.64 
 
 		 742 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  39.95 
 
 		 903 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  38.19 
 
 		 1058 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.11 
 
 		 1382 aa  395  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.33 
 
 		 743 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.2 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  41.35 
 
 		 726 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.94 
 
 		 746 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  41.46 
 
 		 738 aa  363  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.98 
 
 		 704 aa  361  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  39.47 
 
 		 903 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  35.88 
 
 		 807 aa  353  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.41 
 
 		 732 aa  350  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  36.8 
 
 		 732 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.19 
 
 		 735 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.89 
 
 		 729 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.32 
 
 		 735 aa  338  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  32.94 
 
 		 760 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.25 
 
 		 876 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  40.93 
 
 		 726 aa  333  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.59 
 
 		 737 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.99 
 
 		 717 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.06 
 
 		 758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.01 
 
 		 737 aa  327  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  32.35 
 
 		 751 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.16 
 
 		 723 aa  319  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  34.28 
 
 		 718 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.56 
 
 		 752 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.16 
 
 		 715 aa  313  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.2 
 
 		 761 aa  308  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.82 
 
 		 740 aa  301  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.22 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.34 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.62 
 
 		 749 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  34.89 
 
 		 836 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  37.27 
 
 		 750 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.01 
 
 		 796 aa  279  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.36 
 
 		 781 aa  273  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  30.66 
 
 		 711 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.73 
 
 		 979 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.97 
 
 		 983 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.97 
 
 		 983 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  38.2 
 
 		 724 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.27 
 
 		 978 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.76 
 
 		 968 aa  250  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.33 
 
 		 966 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.42 
 
 		 737 aa  223  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.32 
 
 		 758 aa  223  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 736 aa  220  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  31.67 
 
 		 757 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.15 
 
 		 846 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.53 
 
 		 741 aa  210  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.77 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  29.86 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.03 
 
 		 738 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 737 aa  207  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.12 
 
 		 740 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 718 aa  202  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.88 
 
 		 997 aa  198  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.09 
 
 		 743 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.58 
 
 		 730 aa  197  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.76 
 
 		 730 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.02 
 
 		 741 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>