More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3162 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  64.6 
 
 		 726 aa  700    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  68.28 
 
 		 726 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  62.34 
 
 		 729 aa  745    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  61.69 
 
 		 734 aa  738    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  100 
 
 		 738 aa  1418    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  49.32 
 
 		 734 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  49.66 
 
 		 731 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  48.33 
 
 		 728 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  49.65 
 
 		 723 aa  552  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  47.23 
 
 		 735 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  47.14 
 
 		 832 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  48.95 
 
 		 724 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  46.86 
 
 		 737 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  46.14 
 
 		 735 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  48 
 
 		 755 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  48.91 
 
 		 1058 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  46.55 
 
 		 807 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  44.67 
 
 		 793 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  42.6 
 
 		 779 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  43.29 
 
 		 787 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  44.55 
 
 		 734 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  47.26 
 
 		 732 aa  469  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  42.39 
 
 		 779 aa  462  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  41.9 
 
 		 917 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  41.18 
 
 		 732 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  42.16 
 
 		 909 aa  439  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.73 
 
 		 920 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.66 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.66 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  40.6 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  44.63 
 
 		 737 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  45.54 
 
 		 854 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  44.9 
 
 		 903 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  38.22 
 
 		 742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.54 
 
 		 1092 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  41.99 
 
 		 1002 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.67 
 
 		 746 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  45.23 
 
 		 903 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  40.67 
 
 		 791 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.48 
 
 		 1382 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  39.01 
 
 		 760 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.11 
 
 		 893 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  41.46 
 
 		 784 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.13 
 
 		 735 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.85 
 
 		 704 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  39.45 
 
 		 958 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  35.81 
 
 		 743 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  41.12 
 
 		 843 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.52 
 
 		 842 aa  366  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  41.4 
 
 		 840 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.34 
 
 		 717 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  39.77 
 
 		 787 aa  343  8e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.64 
 
 		 752 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.97 
 
 		 732 aa  340  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  36.66 
 
 		 758 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.37 
 
 		 729 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.9 
 
 		 737 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.39 
 
 		 726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.01 
 
 		 735 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.13 
 
 		 718 aa  317  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.81 
 
 		 715 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.31 
 
 		 749 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.9 
 
 		 711 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  34.32 
 
 		 876 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.08 
 
 		 751 aa  299  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.13 
 
 		 796 aa  299  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.94 
 
 		 723 aa  294  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.93 
 
 		 724 aa  286  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.91 
 
 		 781 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.93 
 
 		 740 aa  281  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.42 
 
 		 750 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.47 
 
 		 714 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.34 
 
 		 761 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  34.59 
 
 		 836 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.38 
 
 		 968 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.62 
 
 		 983 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.62 
 
 		 983 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.62 
 
 		 979 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.21 
 
 		 978 aa  238  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.92 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.85 
 
 		 738 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.4 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  33.82 
 
 		 709 aa  227  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.42 
 
 		 966 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.9 
 
 		 741 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.56 
 
 		 710 aa  217  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.45 
 
 		 740 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.81 
 
 		 734 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.48 
 
 		 733 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.29 
 
 		 743 aa  210  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.12 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  31.07 
 
 		 736 aa  208  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.05 
 
 		 751 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.67 
 
 		 741 aa  204  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  31.29 
 
 		 743 aa  200  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.81 
 
 		 737 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  35.51 
 
 		 841 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  28.9 
 
 		 805 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>