More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2864 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  55.23 
 
 		 732 aa  675    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  55.85 
 
 		 876 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  56.62 
 
 		 751 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 715 aa  1380    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  43.33 
 
 		 711 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  45.45 
 
 		 723 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  37.5 
 
 		 743 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  40.7 
 
 		 717 aa  429  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39 
 
 		 729 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 755 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 842 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  39.49 
 
 		 752 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  38.12 
 
 		 758 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  41.1 
 
 		 731 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.81 
 
 		 735 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  39.05 
 
 		 728 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.2 
 
 		 735 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  37.37 
 
 		 917 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  39.75 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.36 
 
 		 760 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  41.55 
 
 		 726 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  37.11 
 
 		 920 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  32.92 
 
 		 829 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  39.17 
 
 		 723 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  36.27 
 
 		 909 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  39.48 
 
 		 832 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  38.55 
 
 		 737 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  32.92 
 
 		 829 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  37.23 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  36.83 
 
 		 732 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  39.37 
 
 		 724 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.68 
 
 		 796 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  37.24 
 
 		 737 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  39.09 
 
 		 761 aa  363  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  38.91 
 
 		 750 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.31 
 
 		 735 aa  362  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  36.49 
 
 		 740 aa  362  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  39.54 
 
 		 714 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.49 
 
 		 734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.46 
 
 		 781 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  37.83 
 
 		 793 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  33.46 
 
 		 772 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 		 772 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 		 772 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  37.74 
 
 		 807 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.82 
 
 		 893 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.12 
 
 		 742 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  36.96 
 
 		 735 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  36.94 
 
 		 734 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  35.25 
 
 		 787 aa  344  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  38.98 
 
 		 743 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  36.59 
 
 		 903 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  41.42 
 
 		 724 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  36.67 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  34.17 
 
 		 779 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  34.27 
 
 		 779 aa  333  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  37.69 
 
 		 732 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  36.41 
 
 		 1002 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  30.9 
 
 		 704 aa  323  5e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.71 
 
 		 1382 aa  320  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.25 
 
 		 791 aa  319  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.83 
 
 		 746 aa  319  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  37.74 
 
 		 903 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.62 
 
 		 854 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  33.07 
 
 		 787 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.61 
 
 		 979 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  37.19 
 
 		 726 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.33 
 
 		 983 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.33 
 
 		 983 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  37.44 
 
 		 958 aa  302  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  34.19 
 
 		 1058 aa  302  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  37.56 
 
 		 1092 aa  300  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  36.4 
 
 		 738 aa  299  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.1 
 
 		 978 aa  299  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  36.14 
 
 		 843 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.29 
 
 		 968 aa  294  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  36.68 
 
 		 840 aa  293  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.66 
 
 		 749 aa  289  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  34.73 
 
 		 784 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  36.96 
 
 		 734 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  34.62 
 
 		 737 aa  280  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  40.26 
 
 		 743 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.79 
 
 		 738 aa  273  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  33.68 
 
 		 743 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 726 aa  266  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.53 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.09 
 
 		 966 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  35.16 
 
 		 710 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.09 
 
 		 758 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  37.16 
 
 		 737 aa  263  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  36.42 
 
 		 743 aa  260  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  38.13 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.38 
 
 		 846 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  35.03 
 
 		 766 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.53 
 
 		 758 aa  247  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  37.75 
 
 		 741 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  33.82 
 
 		 748 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  33.87 
 
 		 754 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.3 
 
 		 805 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>