More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5721 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  73.01 
 
 		 758 aa  1004    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 752 aa  1486    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  52.09 
 
 		 735 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  45.98 
 
 		 760 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  48.34 
 
 		 737 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  47.53 
 
 		 717 aa  600  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  46.9 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  44.99 
 
 		 781 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  43.56 
 
 		 842 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  44.94 
 
 		 718 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  40.7 
 
 		 743 aa  502  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  41.65 
 
 		 749 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  40.98 
 
 		 729 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  45.76 
 
 		 724 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  42.41 
 
 		 731 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  43.44 
 
 		 832 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  41.41 
 
 		 728 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  40.67 
 
 		 734 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  40.38 
 
 		 751 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  39.57 
 
 		 723 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  39.25 
 
 		 735 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.97 
 
 		 876 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  40.97 
 
 		 737 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  41.29 
 
 		 755 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.38 
 
 		 735 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  41.07 
 
 		 723 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  40.48 
 
 		 761 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.47 
 
 		 732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  38.99 
 
 		 735 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  39.6 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  39.51 
 
 		 724 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.62 
 
 		 742 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.12 
 
 		 796 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  39.86 
 
 		 793 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  37.25 
 
 		 787 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.41 
 
 		 746 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  36.87 
 
 		 920 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.65 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.65 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.68 
 
 		 704 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  39.71 
 
 		 715 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 		 743 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  36.84 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  36.55 
 
 		 917 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  38.71 
 
 		 734 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  34.61 
 
 		 779 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  36.03 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.61 
 
 		 750 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.71 
 
 		 740 aa  369  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  35.28 
 
 		 779 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.24 
 
 		 893 aa  363  7.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  37.52 
 
 		 903 aa  354  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  36.5 
 
 		 1002 aa  354  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  35.51 
 
 		 909 aa  351  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.88 
 
 		 1382 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  38.75 
 
 		 1092 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  37.45 
 
 		 711 aa  340  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  36.72 
 
 		 729 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  34.77 
 
 		 791 aa  334  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  35.67 
 
 		 1058 aa  332  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  35.76 
 
 		 807 aa  331  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  39.41 
 
 		 726 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  37.96 
 
 		 854 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  37.61 
 
 		 903 aa  324  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.28 
 
 		 737 aa  321  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  37.03 
 
 		 734 aa  321  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 741 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.52 
 
 		 983 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.52 
 
 		 983 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.52 
 
 		 979 aa  314  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  34.67 
 
 		 787 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  43.52 
 
 		 841 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  36.08 
 
 		 732 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  36.64 
 
 		 738 aa  300  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.18 
 
 		 758 aa  300  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  36.59 
 
 		 968 aa  300  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  36.28 
 
 		 978 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31 
 
 		 740 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  36.1 
 
 		 958 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  38.31 
 
 		 843 aa  293  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  36.98 
 
 		 840 aa  290  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  32.84 
 
 		 784 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 1155 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  32.2 
 
 		 796 aa  283  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.13 
 
 		 737 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.75 
 
 		 846 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 733 aa  277  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.35 
 
 		 966 aa  275  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  32.81 
 
 		 727 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.1 
 
 		 738 aa  270  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.87 
 
 		 743 aa  268  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.52 
 
 		 1308 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.08 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  32.41 
 
 		 736 aa  264  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.85 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  30.68 
 
 		 751 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  32.06 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>