More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5233 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  60.88 
 
 		 732 aa  782    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  71.07 
 
 		 876 aa  955    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 751 aa  1437    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  55.87 
 
 		 715 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  40.71 
 
 		 743 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  42.36 
 
 		 711 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  44.92 
 
 		 723 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  40.56 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  40.33 
 
 		 728 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.7 
 
 		 842 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  42.2 
 
 		 731 aa  425  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.23 
 
 		 735 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  37.83 
 
 		 758 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.82 
 
 		 729 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  39.4 
 
 		 755 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 		 832 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  37.85 
 
 		 920 aa  405  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  40.19 
 
 		 737 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  38.58 
 
 		 734 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.91 
 
 		 760 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.45 
 
 		 735 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  37.16 
 
 		 732 aa  399  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  39.75 
 
 		 735 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  39.72 
 
 		 723 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.55 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.55 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  38.66 
 
 		 717 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  39.22 
 
 		 917 aa  382  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  39.46 
 
 		 761 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 		 734 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 		 793 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  38.83 
 
 		 737 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  35.86 
 
 		 787 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  34.76 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  36.59 
 
 		 909 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  34.76 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  34.76 
 
 		 772 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  40.03 
 
 		 743 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  38.62 
 
 		 735 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  39.64 
 
 		 724 aa  364  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  40.26 
 
 		 714 aa  363  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.18 
 
 		 796 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  38.61 
 
 		 740 aa  363  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  39.37 
 
 		 750 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  40.14 
 
 		 726 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.51 
 
 		 742 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  34.55 
 
 		 779 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.21 
 
 		 781 aa  349  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  38.63 
 
 		 854 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.81 
 
 		 1382 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  31.1 
 
 		 893 aa  335  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.51 
 
 		 779 aa  334  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 1002 aa  329  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  38.38 
 
 		 732 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.9 
 
 		 746 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.97 
 
 		 704 aa  323  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 718 aa  320  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1092 aa  317  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  41.13 
 
 		 724 aa  317  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  35.03 
 
 		 807 aa  317  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.76 
 
 		 791 aa  317  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  36.11 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  37.33 
 
 		 734 aa  316  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  36.53 
 
 		 1058 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  38.27 
 
 		 903 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  35.45 
 
 		 787 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  36.95 
 
 		 843 aa  295  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.83 
 
 		 749 aa  294  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  32.6 
 
 		 784 aa  294  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.47 
 
 		 979 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  36.28 
 
 		 983 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  36.28 
 
 		 983 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  36.97 
 
 		 840 aa  291  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  39.24 
 
 		 734 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  38.53 
 
 		 726 aa  290  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.51 
 
 		 737 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  35.53 
 
 		 958 aa  288  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  35.57 
 
 		 903 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  36.43 
 
 		 978 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  37.84 
 
 		 968 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.67 
 
 		 743 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.55 
 
 		 740 aa  271  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  35.36 
 
 		 738 aa  264  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.07 
 
 		 758 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.75 
 
 		 743 aa  260  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  48.33 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  39.13 
 
 		 726 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  33.24 
 
 		 710 aa  257  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  33.16 
 
 		 733 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 741 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.69 
 
 		 966 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  32.84 
 
 		 718 aa  249  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.44 
 
 		 846 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.07 
 
 		 761 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  33.88 
 
 		 717 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  34.52 
 
 		 766 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  34.57 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  31.33 
 
 		 737 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.6 
 
 		 738 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  35.51 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>