More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7072 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  100 
 
 		 710 aa  1381    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  44.09 
 
 		 733 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.12 
 
 		 1095 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  38.26 
 
 		 1013 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  40.77 
 
 		 740 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  40.24 
 
 		 766 aa  475  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  43.1 
 
 		 717 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  40.31 
 
 		 944 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  39.94 
 
 		 731 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  36.41 
 
 		 805 aa  429  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.2 
 
 		 1308 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  37.89 
 
 		 738 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  34.97 
 
 		 997 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  36.79 
 
 		 741 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  36.88 
 
 		 796 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  40.89 
 
 		 762 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  37.07 
 
 		 770 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  36.27 
 
 		 736 aa  402  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  35.91 
 
 		 751 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  35.18 
 
 		 769 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  35.18 
 
 		 769 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  35.44 
 
 		 1155 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  36.51 
 
 		 738 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  36.62 
 
 		 783 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.7 
 
 		 743 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  37.41 
 
 		 727 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  35.64 
 
 		 754 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  35.64 
 
 		 748 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.16 
 
 		 758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.89 
 
 		 724 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  34.77 
 
 		 773 aa  346  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  34.36 
 
 		 767 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  37.21 
 
 		 738 aa  345  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  34.49 
 
 		 767 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  34.49 
 
 		 767 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  34.09 
 
 		 839 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  34.62 
 
 		 778 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.47 
 
 		 738 aa  323  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  31.15 
 
 		 730 aa  323  7e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  34.73 
 
 		 757 aa  323  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  31.15 
 
 		 730 aa  323  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  31.15 
 
 		 730 aa  323  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  31.01 
 
 		 730 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.92 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  31.01 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  30.79 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  34.47 
 
 		 731 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.24 
 
 		 761 aa  320  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  35.24 
 
 		 953 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  31.44 
 
 		 730 aa  313  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  31.19 
 
 		 730 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.91 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.52 
 
 		 730 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  35.06 
 
 		 743 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.28 
 
 		 740 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  29.92 
 
 		 729 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.66 
 
 		 740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.82 
 
 		 717 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  34.74 
 
 		 632 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.9 
 
 		 718 aa  273  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.03 
 
 		 983 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.03 
 
 		 983 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  42.71 
 
 		 1110 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.03 
 
 		 979 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  42.75 
 
 		 1093 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  42.75 
 
 		 1093 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  42.75 
 
 		 1089 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.4 
 
 		 743 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.35 
 
 		 726 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.18 
 
 		 750 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.46 
 
 		 978 aa  253  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.75 
 
 		 737 aa  252  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.52 
 
 		 735 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31 
 
 		 968 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.37 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.47 
 
 		 740 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.07 
 
 		 732 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 		 735 aa  247  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.3 
 
 		 723 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.42 
 
 		 966 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.99 
 
 		 724 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.96 
 
 		 709 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 		 842 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  31.16 
 
 		 735 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  30.64 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  30.69 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.71 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.38 
 
 		 752 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.7 
 
 		 729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.52 
 
 		 829 aa  236  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.52 
 
 		 829 aa  236  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.6 
 
 		 749 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.76 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.5 
 
 		 760 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.56 
 
 		 758 aa  234  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.9 
 
 		 745 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.02 
 
 		 761 aa  234  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.91 
 
 		 704 aa  233  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.45 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.28 
 
 		 734 aa  231  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>