More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4509 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  55.88 
 
 		 728 aa  708    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  54.66 
 
 		 737 aa  666    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  60.88 
 
 		 832 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  55.79 
 
 		 731 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  100 
 
 		 723 aa  1373    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  57.24 
 
 		 755 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  56.53 
 
 		 734 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  51.36 
 
 		 735 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  53.66 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  52.67 
 
 		 793 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  51.01 
 
 		 735 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  52.12 
 
 		 734 aa  591  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  51.82 
 
 		 734 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  45.57 
 
 		 779 aa  575  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  50.96 
 
 		 729 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  45.68 
 
 		 787 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  39.07 
 
 		 829 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  39.07 
 
 		 829 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  52.19 
 
 		 726 aa  515  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  43.02 
 
 		 779 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.73 
 
 		 1382 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  42.86 
 
 		 920 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.32 
 
 		 746 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  44.22 
 
 		 909 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  48.36 
 
 		 1058 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  45.21 
 
 		 917 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  49.31 
 
 		 738 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  42.65 
 
 		 772 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  42.65 
 
 		 772 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  42.65 
 
 		 772 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  37.07 
 
 		 893 aa  482  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  44.7 
 
 		 1002 aa  482  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  38.9 
 
 		 704 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  43.87 
 
 		 732 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  47.24 
 
 		 854 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  46.04 
 
 		 903 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.5 
 
 		 743 aa  462  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  42.63 
 
 		 791 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  40.19 
 
 		 742 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  50.82 
 
 		 726 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  45.1 
 
 		 732 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  42.26 
 
 		 784 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  47.52 
 
 		 1092 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  46.13 
 
 		 903 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  44.21 
 
 		 737 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  43.63 
 
 		 787 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  42.44 
 
 		 807 aa  426  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  49.2 
 
 		 843 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  40.88 
 
 		 842 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  48.05 
 
 		 840 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  39.18 
 
 		 735 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  42.77 
 
 		 958 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.08 
 
 		 729 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.19 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  40.42 
 
 		 752 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  39.35 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  39 
 
 		 723 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.56 
 
 		 735 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.76 
 
 		 760 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.25 
 
 		 796 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  37.88 
 
 		 758 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.82 
 
 		 876 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  40.11 
 
 		 726 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  38.41 
 
 		 737 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  39.48 
 
 		 751 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  38.49 
 
 		 740 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.58 
 
 		 718 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  41.55 
 
 		 836 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  38.2 
 
 		 750 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.29 
 
 		 711 aa  352  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 		 761 aa  351  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  39.17 
 
 		 715 aa  347  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  40.68 
 
 		 743 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  40.59 
 
 		 724 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.81 
 
 		 749 aa  319  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.88 
 
 		 714 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 781 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  38.03 
 
 		 734 aa  303  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.31 
 
 		 758 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  33.65 
 
 		 766 aa  279  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.27 
 
 		 741 aa  273  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.14 
 
 		 770 aa  267  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.05 
 
 		 979 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.05 
 
 		 983 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.05 
 
 		 983 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  36.49 
 
 		 978 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.23 
 
 		 968 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.62 
 
 		 740 aa  257  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  32.59 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.96 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.58 
 
 		 738 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  32.58 
 
 		 733 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  32.78 
 
 		 1155 aa  253  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.62 
 
 		 710 aa  246  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 846 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 731 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  32.56 
 
 		 736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  30.91 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.02 
 
 		 717 aa  239  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.56 
 
 		 741 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>