More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7233 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  100 
 
 		 742 aa  1469    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  53.8 
 
 		 732 aa  724    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  45.49 
 
 		 832 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  42.58 
 
 		 737 aa  544  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  44.47 
 
 		 735 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  43.98 
 
 		 755 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.07 
 
 		 734 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  42.93 
 
 		 735 aa  505  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.52 
 
 		 724 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  41.18 
 
 		 787 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  41.49 
 
 		 728 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  41.88 
 
 		 731 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  42.86 
 
 		 793 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  43.42 
 
 		 734 aa  482  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  40.27 
 
 		 723 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  37.68 
 
 		 779 aa  449  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  37.3 
 
 		 779 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  39.4 
 
 		 909 aa  445  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.06 
 
 		 829 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  37.14 
 
 		 743 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.06 
 
 		 829 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  40.78 
 
 		 1002 aa  438  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  37.17 
 
 		 920 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  38.65 
 
 		 917 aa  432  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  38.1 
 
 		 717 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  36.06 
 
 		 772 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  36.06 
 
 		 772 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  36.06 
 
 		 772 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.69 
 
 		 729 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32.97 
 
 		 893 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.67 
 
 		 735 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.53 
 
 		 842 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 		 903 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.59 
 
 		 737 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.48 
 
 		 735 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  35.62 
 
 		 752 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.21 
 
 		 746 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.99 
 
 		 758 aa  389  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  38.06 
 
 		 734 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 787 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  40.87 
 
 		 843 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.64 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  37.75 
 
 		 876 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  40.48 
 
 		 903 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.7 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.34 
 
 		 718 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.42 
 
 		 796 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.38 
 
 		 704 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.81 
 
 		 1382 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 784 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  39.76 
 
 		 840 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  38.01 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  36.21 
 
 		 791 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  36.67 
 
 		 1058 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.98 
 
 		 854 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.89 
 
 		 723 aa  352  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 726 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  38.01 
 
 		 726 aa  347  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  35.67 
 
 		 714 aa  344  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.64 
 
 		 751 aa  339  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  36.98 
 
 		 958 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  36.51 
 
 		 732 aa  333  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1092 aa  333  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  38.22 
 
 		 738 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.01 
 
 		 737 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.97 
 
 		 781 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  35.38 
 
 		 807 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.78 
 
 		 749 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.75 
 
 		 724 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.58 
 
 		 740 aa  312  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  38.8 
 
 		 726 aa  310  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.17 
 
 		 750 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 743 aa  296  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.78 
 
 		 761 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.78 
 
 		 711 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  31.94 
 
 		 836 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  32.7 
 
 		 734 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.3 
 
 		 979 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.73 
 
 		 983 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.73 
 
 		 983 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.4 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.75 
 
 		 966 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.35 
 
 		 978 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.35 
 
 		 766 aa  232  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  27.8 
 
 		 743 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.17 
 
 		 710 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.34 
 
 		 730 aa  227  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.34 
 
 		 730 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  25.39 
 
 		 730 aa  226  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.21 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.34 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.34 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.34 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.04 
 
 		 846 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.93 
 
 		 741 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  26.42 
 
 		 730 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.56 
 
 		 730 aa  225  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  35.84 
 
 		 841 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 733 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.81 
 
 		 730 aa  221  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>