More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3036 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  50.51 
 
 
903 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  59.51 
 
 
1002 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  49.28 
 
 
903 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  100 
 
 
917 aa  1748    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  47.81 
 
 
909 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  46.42 
 
 
920 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  44.26 
 
 
832 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  45.68 
 
 
735 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  45.61 
 
 
734 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  45.76 
 
 
755 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  45.62 
 
 
735 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  43.87 
 
 
737 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  45.53 
 
 
723 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  45.31 
 
 
731 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  44.49 
 
 
728 aa  505  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  45.36 
 
 
724 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  44.52 
 
 
793 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  43.37 
 
 
787 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  43.9 
 
 
734 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  38.94 
 
 
779 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.89 
 
 
772 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.82 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.89 
 
 
772 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  40.89 
 
 
772 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.22 
 
 
743 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  39.5 
 
 
779 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  38.52 
 
 
742 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  41.48 
 
 
729 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  41.11 
 
 
791 aa  426  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.94 
 
 
829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.94 
 
 
829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  34.21 
 
 
893 aa  422  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  37.16 
 
 
784 aa  416  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  45.19 
 
 
958 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  43.53 
 
 
843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  41.04 
 
 
734 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  44.66 
 
 
840 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  39.87 
 
 
876 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  39.29 
 
 
787 aa  399  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  40.51 
 
 
854 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.11 
 
 
732 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  44.06 
 
 
726 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.29 
 
 
746 aa  392  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  42.09 
 
 
738 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.48 
 
 
842 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.87 
 
 
729 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  41.15 
 
 
807 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.74 
 
 
1382 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.88 
 
 
752 aa  376  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.73 
 
 
704 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  39.08 
 
 
751 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.06 
 
 
735 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.63 
 
 
715 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.07 
 
 
1092 aa  366  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.63 
 
 
758 aa  362  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.33 
 
 
760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.87 
 
 
735 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  41.26 
 
 
732 aa  357  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.65 
 
 
718 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.05 
 
 
717 aa  354  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.62 
 
 
737 aa  353  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  38.72 
 
 
1058 aa  348  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.89 
 
 
711 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  43.1 
 
 
726 aa  342  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  38.38 
 
 
737 aa  336  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  37.41 
 
 
714 aa  332  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.48 
 
 
796 aa  331  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.05 
 
 
740 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.51 
 
 
749 aa  325  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.99 
 
 
726 aa  324  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  35.07 
 
 
750 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.86 
 
 
723 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.12 
 
 
761 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.4 
 
 
781 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.71 
 
 
724 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.49 
 
 
743 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  33.16 
 
 
733 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.82 
 
 
758 aa  260  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.64 
 
 
734 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  34.04 
 
 
736 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.3 
 
 
743 aa  246  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.32 
 
 
979 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.18 
 
 
983 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.18 
 
 
983 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.27 
 
 
741 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  32.52 
 
 
836 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.54 
 
 
740 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.91 
 
 
766 aa  238  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.5 
 
 
738 aa  234  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.9 
 
 
978 aa  229  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.68 
 
 
737 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.02 
 
 
751 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.72 
 
 
968 aa  225  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  30.49 
 
 
737 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  43.21 
 
 
776 aa  225  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.89 
 
 
717 aa  224  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.19 
 
 
730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.32 
 
 
730 aa  217  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.32 
 
 
730 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.32 
 
 
730 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>