More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7157 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  100 
 
 		 723 aa  1385    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  46.09 
 
 		 732 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  40.56 
 
 		 743 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  41.64 
 
 		 717 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  45.31 
 
 		 715 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  41.9 
 
 		 842 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  42.76 
 
 		 755 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  44.92 
 
 		 751 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  42.42 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  39.94 
 
 		 728 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  40.14 
 
 		 734 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  40.62 
 
 		 832 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39 
 
 		 758 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  40.3 
 
 		 740 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  40.38 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  39.11 
 
 		 752 aa  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  39.32 
 
 		 735 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  38.09 
 
 		 737 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  40.22 
 
 		 750 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  39.34 
 
 		 723 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  32.59 
 
 		 829 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  32.59 
 
 		 829 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.16 
 
 		 729 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  40.86 
 
 		 761 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.53 
 
 		 711 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  41.36 
 
 		 726 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.83 
 
 		 718 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  40.52 
 
 		 737 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.31 
 
 		 735 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  38.64 
 
 		 793 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.79 
 
 		 734 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.31 
 
 		 796 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.6 
 
 		 735 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.75 
 
 		 760 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  37.8 
 
 		 735 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  43.11 
 
 		 724 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  36.24 
 
 		 732 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  34.03 
 
 		 742 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  41.11 
 
 		 743 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  36.57 
 
 		 787 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  35.71 
 
 		 909 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  38.21 
 
 		 724 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  34.58 
 
 		 920 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.63 
 
 		 893 aa  361  3e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  39.86 
 
 		 714 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.16 
 
 		 704 aa  355  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.97 
 
 		 781 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  34.36 
 
 		 779 aa  354  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  34.58 
 
 		 772 aa  353  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  34.58 
 
 		 772 aa  353  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  34.58 
 
 		 772 aa  353  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  37.13 
 
 		 903 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  34.86 
 
 		 917 aa  326  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.91 
 
 		 854 aa  324  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.38 
 
 		 746 aa  323  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  35.04 
 
 		 1058 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  34.21 
 
 		 787 aa  311  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  36.51 
 
 		 903 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.16 
 
 		 791 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  37.19 
 
 		 843 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.88 
 
 		 1002 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  33.42 
 
 		 734 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  34.06 
 
 		 958 aa  306  7e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.54 
 
 		 1382 aa  306  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.75 
 
 		 749 aa  303  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  34.1 
 
 		 807 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  38.99 
 
 		 1092 aa  301  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.54 
 
 		 758 aa  296  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.11 
 
 		 979 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  35.88 
 
 		 779 aa  293  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  36.35 
 
 		 743 aa  293  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.97 
 
 		 983 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.97 
 
 		 983 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.75 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 784 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.48 
 
 		 741 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.07 
 
 		 726 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  35.07 
 
 		 732 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  36.65 
 
 		 740 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  33.86 
 
 		 751 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  36.42 
 
 		 840 aa  281  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  34.73 
 
 		 736 aa  276  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  37.71 
 
 		 978 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  33.66 
 
 		 738 aa  275  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  33.08 
 
 		 769 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  33.08 
 
 		 769 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  37.07 
 
 		 846 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  32.57 
 
 		 729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 770 aa  271  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  35.09 
 
 		 727 aa  271  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.38 
 
 		 1155 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  34.67 
 
 		 737 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  35.83 
 
 		 966 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  37.74 
 
 		 736 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  33.05 
 
 		 738 aa  265  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  37.36 
 
 		 968 aa  264  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  33.94 
 
 		 738 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  36.4 
 
 		 766 aa  260  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  36.92 
 
 		 805 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  40.2 
 
 		 741 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>