More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2131 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  52.02 
 
 
736 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  50.95 
 
 
738 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  68.14 
 
 
748 aa  889    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  63.26 
 
 
767 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  72.58 
 
 
769 aa  1030    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  53.57 
 
 
770 aa  722    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  68.14 
 
 
754 aa  888    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  63.26 
 
 
767 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  72.58 
 
 
769 aa  1030    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  67.26 
 
 
743 aa  903    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  68.01 
 
 
727 aa  899    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  64.17 
 
 
1155 aa  902    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  82.03 
 
 
778 aa  1109    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  63.26 
 
 
767 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  74.22 
 
 
751 aa  1037    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  58.41 
 
 
731 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
738 aa  1439    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  70.75 
 
 
500 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  44.27 
 
 
796 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  43.09 
 
 
741 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.26 
 
 
724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.09 
 
 
740 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  41.57 
 
 
839 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  39.54 
 
 
733 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  40.84 
 
 
783 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.72 
 
 
766 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  39.43 
 
 
953 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  36.51 
 
 
710 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.75 
 
 
717 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.86 
 
 
740 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.8 
 
 
1308 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.65 
 
 
805 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  34.09 
 
 
758 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  37.18 
 
 
731 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  62.68 
 
 
361 aa  350  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  36.28 
 
 
738 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.38 
 
 
741 aa  330  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  31.79 
 
 
1013 aa  323  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  36.23 
 
 
762 aa  321  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.99 
 
 
738 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.48 
 
 
1095 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.29 
 
 
944 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.51 
 
 
761 aa  302  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.26 
 
 
730 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.26 
 
 
730 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.4 
 
 
730 aa  286  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.4 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.4 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.4 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.22 
 
 
730 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.04 
 
 
730 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  28.75 
 
 
997 aa  283  8.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.09 
 
 
730 aa  283  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  45.41 
 
 
773 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.18 
 
 
729 aa  278  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.48 
 
 
730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.72 
 
 
743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.42 
 
 
717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.76 
 
 
709 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.55 
 
 
757 aa  258  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.69 
 
 
758 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.33 
 
 
723 aa  253  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.7 
 
 
740 aa  253  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  33.59 
 
 
842 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.93 
 
 
743 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.38 
 
 
735 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.6 
 
 
752 aa  237  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.59 
 
 
704 aa  237  7e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 
781 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.57 
 
 
724 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.89 
 
 
979 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.25 
 
 
983 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.25 
 
 
983 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 
846 aa  230  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.55 
 
 
723 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.7 
 
 
829 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.7 
 
 
829 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.75 
 
 
726 aa  227  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.83 
 
 
741 aa  227  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32 
 
 
743 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.88 
 
 
832 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  28.86 
 
 
758 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.69 
 
 
718 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.21 
 
 
761 aa  224  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.63 
 
 
978 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.93 
 
 
737 aa  220  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  33.27 
 
 
734 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.31 
 
 
893 aa  213  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.29 
 
 
731 aa  213  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  30.34 
 
 
718 aa  210  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.96 
 
 
966 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.7 
 
 
714 aa  208  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.38 
 
 
750 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  33.88 
 
 
704 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.03 
 
 
735 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.53 
 
 
728 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  30.64 
 
 
732 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.03 
 
 
735 aa  204  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  32.14 
 
 
737 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  27.05 
 
 
760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>