More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2330 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  67.52 
 
 
738 aa  939    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  51.4 
 
 
770 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  100 
 
 
748 aa  1456    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  63.15 
 
 
767 aa  832    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  65.96 
 
 
769 aa  914    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  52.01 
 
 
736 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  99.87 
 
 
754 aa  1452    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  63.15 
 
 
767 aa  832    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  65.96 
 
 
769 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  66.99 
 
 
727 aa  867    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  63.77 
 
 
1155 aa  881    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  67.15 
 
 
778 aa  904    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  63.28 
 
 
767 aa  831    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  66.48 
 
 
743 aa  878    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  67.3 
 
 
751 aa  923    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  58.73 
 
 
731 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  71.03 
 
 
500 aa  595  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  49.73 
 
 
738 aa  592  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  45.35 
 
 
796 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  43.65 
 
 
783 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  40.67 
 
 
741 aa  456  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.64 
 
 
724 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.36 
 
 
740 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  38.01 
 
 
733 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  39.39 
 
 
839 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.82 
 
 
766 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.24 
 
 
717 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  39.5 
 
 
953 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  36.09 
 
 
710 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  34.06 
 
 
758 aa  366  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.92 
 
 
740 aa  362  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  35.1 
 
 
805 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.13 
 
 
1308 aa  356  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.38 
 
 
731 aa  330  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  35.25 
 
 
738 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.87 
 
 
741 aa  323  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  58.62 
 
 
361 aa  312  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  36.3 
 
 
762 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.3 
 
 
1095 aa  303  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.78 
 
 
1013 aa  300  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.18 
 
 
761 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  28.7 
 
 
997 aa  286  9e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.99 
 
 
944 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.49 
 
 
730 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  44.33 
 
 
773 aa  283  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.22 
 
 
730 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.67 
 
 
730 aa  283  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.67 
 
 
730 aa  283  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.67 
 
 
730 aa  283  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  35.41 
 
 
743 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.22 
 
 
738 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.55 
 
 
730 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  25.24 
 
 
730 aa  277  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.82 
 
 
730 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.42 
 
 
730 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  25.42 
 
 
730 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.68 
 
 
729 aa  260  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.49 
 
 
846 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.61 
 
 
717 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.93 
 
 
757 aa  253  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  33.42 
 
 
709 aa  250  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.8 
 
 
743 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.68 
 
 
752 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.9 
 
 
723 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.68 
 
 
842 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.64 
 
 
718 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.47 
 
 
735 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.85 
 
 
983 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.85 
 
 
983 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.89 
 
 
723 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.85 
 
 
979 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.29 
 
 
743 aa  227  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 
829 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 
829 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.57 
 
 
724 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.06 
 
 
704 aa  225  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  32.93 
 
 
715 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.61 
 
 
740 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.52 
 
 
741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.61 
 
 
726 aa  223  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.49 
 
 
758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.92 
 
 
978 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.13 
 
 
758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  25.29 
 
 
893 aa  216  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.6 
 
 
737 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  31.69 
 
 
832 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.64 
 
 
966 aa  211  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  34.97 
 
 
704 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.59 
 
 
728 aa  210  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.63 
 
 
761 aa  210  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  26.53 
 
 
781 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  27.6 
 
 
743 aa  206  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.57 
 
 
796 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.81 
 
 
968 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  33.64 
 
 
732 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.26 
 
 
731 aa  201  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.23 
 
 
735 aa  200  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  33.44 
 
 
734 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  30.41 
 
 
732 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.91 
 
 
734 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>