More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4064 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  49.29 
 
 		 738 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  53.54 
 
 		 770 aa  738    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  67.13 
 
 		 748 aa  888    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  62.09 
 
 		 767 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  100 
 
 		 769 aa  1511    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  65.22 
 
 		 743 aa  879    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  67.13 
 
 		 754 aa  888    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  62.09 
 
 		 767 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 769 aa  1511    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  64.99 
 
 		 727 aa  865    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  63.75 
 
 		 1155 aa  906    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  74.81 
 
 		 778 aa  1033    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  62.09 
 
 		 767 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  97.53 
 
 		 751 aa  1411    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  52.32 
 
 		 736 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  58.58 
 
 		 731 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  72.58 
 
 		 738 aa  1044    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  69.18 
 
 		 500 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  43.19 
 
 		 796 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  41.46 
 
 		 741 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.73 
 
 		 724 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  42.02 
 
 		 783 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  40.43 
 
 		 773 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  38.17 
 
 		 733 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.53 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.42 
 
 		 740 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  38.06 
 
 		 839 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  38.85 
 
 		 953 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 		 740 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  35.71 
 
 		 710 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  39.34 
 
 		 717 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.43 
 
 		 805 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  35.05 
 
 		 758 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.14 
 
 		 1308 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.78 
 
 		 731 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.52 
 
 		 741 aa  337  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  33.97 
 
 		 738 aa  336  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  35.74 
 
 		 762 aa  330  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  60.92 
 
 		 361 aa  330  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.87 
 
 		 738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.27 
 
 		 1013 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.86 
 
 		 1095 aa  303  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.6 
 
 		 761 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.85 
 
 		 743 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  30.82 
 
 		 944 aa  291  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.87 
 
 		 997 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.29 
 
 		 709 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.78 
 
 		 730 aa  273  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  30.46 
 
 		 730 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  30.46 
 
 		 730 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  30.46 
 
 		 730 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.29 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  30.12 
 
 		 730 aa  265  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.18 
 
 		 729 aa  264  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.79 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  29.27 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  29.95 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.78 
 
 		 730 aa  260  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.72 
 
 		 717 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  31.84 
 
 		 757 aa  253  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  32.29 
 
 		 745 aa  252  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.14 
 
 		 743 aa  250  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.08 
 
 		 723 aa  250  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.33 
 
 		 758 aa  246  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.79 
 
 		 740 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.51 
 
 		 979 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.51 
 
 		 983 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.51 
 
 		 983 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.03 
 
 		 723 aa  244  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.66 
 
 		 735 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.55 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.09 
 
 		 752 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.25 
 
 		 726 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  29.67 
 
 		 832 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.07 
 
 		 829 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.95 
 
 		 735 aa  229  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.07 
 
 		 829 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.23 
 
 		 724 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.93 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.36 
 
 		 735 aa  226  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.37 
 
 		 842 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.32 
 
 		 846 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  28.59 
 
 		 978 aa  223  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.49 
 
 		 781 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.99 
 
 		 741 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.05 
 
 		 966 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  29.48 
 
 		 731 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.37 
 
 		 893 aa  218  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  30.76 
 
 		 714 aa  217  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.67 
 
 		 718 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.35 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.74 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.66 
 
 		 734 aa  214  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.69 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.24 
 
 		 737 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  28.74 
 
 		 728 aa  207  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  34.5 
 
 		 734 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  32.55 
 
 		 732 aa  204  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.22 
 
 		 704 aa  203  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.19 
 
 		 750 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>