More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2977 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  63.87 
 
 
748 aa  820    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  100 
 
 
767 aa  1478    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  62.09 
 
 
769 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  62.08 
 
 
743 aa  835    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  51.25 
 
 
770 aa  703    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  63.87 
 
 
754 aa  819    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
767 aa  1478    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  62.09 
 
 
769 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  63.03 
 
 
727 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  58.79 
 
 
1155 aa  811    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  63.84 
 
 
778 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  99.22 
 
 
767 aa  1466    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  62.67 
 
 
751 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  53.9 
 
 
731 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  63.26 
 
 
738 aa  876    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  50 
 
 
736 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  50.2 
 
 
738 aa  604  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  62 
 
 
500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  42.94 
 
 
796 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  39.79 
 
 
741 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  40.22 
 
 
773 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.36 
 
 
724 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  40.08 
 
 
783 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 
733 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.77 
 
 
740 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.77 
 
 
766 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  38.76 
 
 
839 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  39.07 
 
 
953 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.27 
 
 
717 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.63 
 
 
710 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.74 
 
 
740 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.71 
 
 
758 aa  355  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.98 
 
 
1308 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  34.04 
 
 
738 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.77 
 
 
731 aa  335  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.18 
 
 
805 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  58.8 
 
 
361 aa  314  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.95 
 
 
1013 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  36.03 
 
 
762 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.66 
 
 
741 aa  311  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.66 
 
 
738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  37.38 
 
 
761 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  31.11 
 
 
944 aa  292  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  36.6 
 
 
743 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.52 
 
 
1095 aa  281  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.74 
 
 
730 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.55 
 
 
730 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.55 
 
 
730 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.55 
 
 
730 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.57 
 
 
730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.17 
 
 
709 aa  270  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.8 
 
 
730 aa  269  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.45 
 
 
730 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  28.14 
 
 
997 aa  265  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.42 
 
 
730 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.13 
 
 
730 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.92 
 
 
730 aa  260  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.91 
 
 
757 aa  255  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.08 
 
 
740 aa  250  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.5 
 
 
729 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.2 
 
 
752 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.78 
 
 
842 aa  240  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.89 
 
 
846 aa  238  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.21 
 
 
735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.43 
 
 
724 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  32.92 
 
 
745 aa  233  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.52 
 
 
758 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.67 
 
 
717 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.42 
 
 
781 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.19 
 
 
758 aa  224  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.22 
 
 
726 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.06 
 
 
723 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.16 
 
 
743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.56 
 
 
743 aa  217  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.48 
 
 
832 aa  217  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  32.69 
 
 
761 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.46 
 
 
741 aa  215  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.45 
 
 
723 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.2 
 
 
737 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.63 
 
 
718 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.08 
 
 
983 aa  207  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.08 
 
 
983 aa  207  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.08 
 
 
979 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.91 
 
 
704 aa  206  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.76 
 
 
829 aa  204  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.76 
 
 
829 aa  204  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.86 
 
 
734 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.08 
 
 
978 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.9 
 
 
750 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  32.87 
 
 
743 aa  197  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  33.03 
 
 
704 aa  197  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.78 
 
 
760 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  30 
 
 
735 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.76 
 
 
731 aa  194  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.93 
 
 
749 aa  194  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.23 
 
 
743 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  31.47 
 
 
737 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 
735 aa  190  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.6 
 
 
876 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.38 
 
 
966 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>