More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0188 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  51.88 
 
 		 846 aa  664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  100 
 
 		 743 aa  1468    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  49.86 
 
 		 743 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  47.32 
 
 		 744 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  47.8 
 
 		 847 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  42.84 
 
 		 745 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  43.13 
 
 		 736 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  40.53 
 
 		 737 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  37.99 
 
 		 794 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  36.85 
 
 		 758 aa  350  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.52 
 
 		 743 aa  307  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  33.02 
 
 		 735 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.45 
 
 		 740 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  33.42 
 
 		 842 aa  288  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.96 
 
 		 718 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.81 
 
 		 979 aa  280  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.49 
 
 		 978 aa  280  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.67 
 
 		 983 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.67 
 
 		 983 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.75 
 
 		 758 aa  278  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.82 
 
 		 968 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.09 
 
 		 717 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.91 
 
 		 741 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.97 
 
 		 966 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.36 
 
 		 805 aa  260  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  32.05 
 
 		 758 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.65 
 
 		 723 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.29 
 
 		 876 aa  256  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  32.29 
 
 		 1155 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  31.36 
 
 		 732 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.92 
 
 		 733 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.66 
 
 		 738 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.73 
 
 		 751 aa  253  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.75 
 
 		 740 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  38.13 
 
 		 711 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.63 
 
 		 717 aa  251  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.47 
 
 		 737 aa  251  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 704 aa  250  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.02 
 
 		 743 aa  249  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.35 
 
 		 734 aa  248  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.42 
 
 		 760 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  33.19 
 
 		 751 aa  247  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.83 
 
 		 729 aa  247  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.37 
 
 		 737 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.73 
 
 		 752 aa  246  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.83 
 
 		 749 aa  246  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.43 
 
 		 781 aa  246  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.33 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.46 
 
 		 755 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.43 
 
 		 724 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.29 
 
 		 761 aa  243  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.89 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.42 
 
 		 738 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.58 
 
 		 724 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.63 
 
 		 731 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.78 
 
 		 796 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.62 
 
 		 735 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.46 
 
 		 728 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 718 aa  240  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.11 
 
 		 731 aa  240  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.18 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.75 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  34.04 
 
 		 741 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 766 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.79 
 
 		 727 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  34.66 
 
 		 724 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  31.88 
 
 		 757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.61 
 
 		 730 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.61 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.89 
 
 		 730 aa  235  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  32.54 
 
 		 743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.54 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.54 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.54 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.54 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.09 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.98 
 
 		 761 aa  234  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  31.02 
 
 		 738 aa  233  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.26 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.48 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.05 
 
 		 997 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.76 
 
 		 829 aa  230  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.76 
 
 		 829 aa  230  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  28.99 
 
 		 909 aa  230  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.58 
 
 		 893 aa  230  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.54 
 
 		 726 aa  230  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  33.58 
 
 		 854 aa  230  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.48 
 
 		 1308 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  33.94 
 
 		 832 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  29.97 
 
 		 734 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.7 
 
 		 736 aa  228  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  32.91 
 
 		 737 aa  227  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 751 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  29.2 
 
 		 741 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  28.9 
 
 		 772 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  29.33 
 
 		 920 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  30.88 
 
 		 917 aa  225  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  28.9 
 
 		 772 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  28.74 
 
 		 772 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>