More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7430 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  100 
 
 		 744 aa  1472    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  49.17 
 
 		 846 aa  594  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  44.92 
 
 		 743 aa  541  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  44.4 
 
 		 847 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  47.73 
 
 		 743 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  41.16 
 
 		 745 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 736 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  37.42 
 
 		 737 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  35.87 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  35.1 
 
 		 794 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.63 
 
 		 743 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.2 
 
 		 717 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.87 
 
 		 718 aa  259  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 		 842 aa  259  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.18 
 
 		 758 aa  257  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.67 
 
 		 735 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.29 
 
 		 983 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.29 
 
 		 983 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  32.4 
 
 		 736 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.08 
 
 		 740 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.93 
 
 		 979 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.05 
 
 		 724 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  32.69 
 
 		 758 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  30.88 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.7 
 
 		 723 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  33.97 
 
 		 752 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.31 
 
 		 968 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.34 
 
 		 760 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  30.62 
 
 		 770 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.46 
 
 		 743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.56 
 
 		 978 aa  234  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.19 
 
 		 796 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.01 
 
 		 732 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  28.78 
 
 		 805 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  31.23 
 
 		 737 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  33.01 
 
 		 737 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.07 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  31.46 
 
 		 766 aa  231  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.64 
 
 		 741 aa  230  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.9 
 
 		 731 aa  230  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.35 
 
 		 733 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 1155 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.32 
 
 		 966 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.1 
 
 		 710 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.57 
 
 		 734 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.15 
 
 		 781 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.93 
 
 		 876 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  32.77 
 
 		 743 aa  226  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 		 734 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  31 
 
 		 793 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.81 
 
 		 730 aa  224  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  31.94 
 
 		 839 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.52 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.32 
 
 		 711 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  34.19 
 
 		 732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.45 
 
 		 740 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.63 
 
 		 832 aa  218  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.37 
 
 		 755 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  30.73 
 
 		 751 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  32.78 
 
 		 715 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.5 
 
 		 726 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.34 
 
 		 729 aa  215  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.27 
 
 		 738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.25 
 
 		 769 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.25 
 
 		 769 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.78 
 
 		 714 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.21 
 
 		 730 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.49 
 
 		 737 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.17 
 
 		 751 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.69 
 
 		 724 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.45 
 
 		 730 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.77 
 
 		 749 aa  211  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.32 
 
 		 718 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.74 
 
 		 730 aa  210  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.74 
 
 		 730 aa  210  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.74 
 
 		 730 aa  210  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.74 
 
 		 730 aa  210  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.16 
 
 		 730 aa  209  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.49 
 
 		 730 aa  209  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.58 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.1 
 
 		 704 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.35 
 
 		 1308 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.02 
 
 		 917 aa  207  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  32.69 
 
 		 953 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.72 
 
 		 729 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  30.76 
 
 		 738 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  30.06 
 
 		 717 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.25 
 
 		 727 aa  205  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.17 
 
 		 735 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  30.88 
 
 		 750 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  29.23 
 
 		 748 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  29.23 
 
 		 754 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.6 
 
 		 745 aa  201  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.74 
 
 		 761 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.1 
 
 		 779 aa  201  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.47 
 
 		 740 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.65 
 
 		 728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.53 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  28.93 
 
 		 741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.67 
 
 		 1013 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>