More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8716 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  100 
 
 		 745 aa  1469    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  48.55 
 
 		 736 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  45.8 
 
 		 846 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  43.86 
 
 		 743 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  42.68 
 
 		 743 aa  465  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  40.57 
 
 		 744 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  42.49 
 
 		 847 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  37.69 
 
 		 794 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  36.61 
 
 		 737 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  34.26 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.21 
 
 		 758 aa  301  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.12 
 
 		 740 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.77 
 
 		 983 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.77 
 
 		 983 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 717 aa  270  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.49 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.61 
 
 		 979 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  31.79 
 
 		 766 aa  268  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.18 
 
 		 758 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.22 
 
 		 805 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.05 
 
 		 978 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.93 
 
 		 733 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.87 
 
 		 729 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.83 
 
 		 724 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.21 
 
 		 704 aa  248  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.58 
 
 		 738 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.68 
 
 		 710 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.23 
 
 		 761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.59 
 
 		 741 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.17 
 
 		 968 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.16 
 
 		 730 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.69 
 
 		 966 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.69 
 
 		 729 aa  241  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.33 
 
 		 735 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.82 
 
 		 730 aa  239  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.7 
 
 		 781 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  29.65 
 
 		 738 aa  239  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.08 
 
 		 752 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.35 
 
 		 718 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.01 
 
 		 730 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.72 
 
 		 730 aa  237  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.22 
 
 		 732 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.87 
 
 		 730 aa  236  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.87 
 
 		 730 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.87 
 
 		 730 aa  236  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.39 
 
 		 761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.88 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.72 
 
 		 730 aa  235  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.92 
 
 		 1155 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.04 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.73 
 
 		 724 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.5 
 
 		 737 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.79 
 
 		 740 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.98 
 
 		 741 aa  231  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  30.84 
 
 		 737 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.67 
 
 		 723 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  30.99 
 
 		 796 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.19 
 
 		 750 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.46 
 
 		 737 aa  227  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.4 
 
 		 714 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.68 
 
 		 738 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  30.32 
 
 		 770 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.01 
 
 		 1013 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.35 
 
 		 749 aa  224  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.5 
 
 		 726 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  29.91 
 
 		 743 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.11 
 
 		 736 aa  223  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.4 
 
 		 997 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30 
 
 		 735 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.7 
 
 		 718 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.73 
 
 		 711 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.46 
 
 		 731 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.49 
 
 		 740 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  30.1 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  30.8 
 
 		 909 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.47 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  34.9 
 
 		 731 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.67 
 
 		 723 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  31.8 
 
 		 917 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  29.58 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  33.99 
 
 		 832 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  33.04 
 
 		 717 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.77 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  29.88 
 
 		 751 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.29 
 
 		 758 aa  213  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  32.73 
 
 		 903 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  30.56 
 
 		 727 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  30.93 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.62 
 
 		 1095 aa  212  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  27.76 
 
 		 748 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  27.61 
 
 		 754 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 		 751 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  31.1 
 
 		 731 aa  210  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  28.7 
 
 		 772 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  28.7 
 
 		 772 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  28.7 
 
 		 772 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  28.64 
 
 		 944 aa  208  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  29.09 
 
 		 769 aa  207  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  29.09 
 
 		 769 aa  207  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.69 
 
 		 745 aa  206  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>