More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6982 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  100 
 
 		 794 aa  1570    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  46.77 
 
 		 729 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  43.79 
 
 		 737 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  40.39 
 
 		 743 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 846 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  37.45 
 
 		 847 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  38.06 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  37.26 
 
 		 736 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  37.96 
 
 		 745 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  35.56 
 
 		 744 aa  350  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.88 
 
 		 979 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.71 
 
 		 983 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.71 
 
 		 983 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.89 
 
 		 735 aa  244  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.46 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.55 
 
 		 738 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.87 
 
 		 717 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.72 
 
 		 966 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.92 
 
 		 761 aa  231  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.91 
 
 		 743 aa  230  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.28 
 
 		 978 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.96 
 
 		 735 aa  227  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  33.27 
 
 		 793 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.86 
 
 		 968 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  33.27 
 
 		 734 aa  225  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  30.51 
 
 		 732 aa  224  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  29.44 
 
 		 737 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.79 
 
 		 758 aa  218  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.01 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.43 
 
 		 729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.48 
 
 		 740 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.41 
 
 		 741 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.37 
 
 		 724 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.44 
 
 		 723 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.95 
 
 		 730 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.6 
 
 		 997 aa  210  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.26 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.65 
 
 		 730 aa  210  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.63 
 
 		 730 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.11 
 
 		 752 aa  208  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.45 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.29 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.45 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.45 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31.73 
 
 		 751 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.29 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.52 
 
 		 733 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.12 
 
 		 730 aa  206  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.49 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  28.9 
 
 		 779 aa  205  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.25 
 
 		 1382 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  29.6 
 
 		 715 aa  204  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.26 
 
 		 730 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.31 
 
 		 724 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.89 
 
 		 731 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.8 
 
 		 743 aa  203  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.66 
 
 		 710 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.14 
 
 		 761 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.35 
 
 		 740 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.08 
 
 		 770 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  27.4 
 
 		 772 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  27.4 
 
 		 772 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  27.4 
 
 		 772 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  28.92 
 
 		 741 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.37 
 
 		 760 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.58 
 
 		 766 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.47 
 
 		 740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.86 
 
 		 781 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.48 
 
 		 741 aa  197  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  30.61 
 
 		 854 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  29.07 
 
 		 751 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  31.03 
 
 		 724 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  31.65 
 
 		 709 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.28 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  32.8 
 
 		 735 aa  195  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 		 718 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  31.46 
 
 		 735 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  28.15 
 
 		 876 aa  195  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  24.28 
 
 		 729 aa  193  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.48 
 
 		 757 aa  193  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  30.88 
 
 		 737 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  28.13 
 
 		 839 aa  190  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  26.27 
 
 		 1013 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.35 
 
 		 734 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  30.07 
 
 		 958 aa  189  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.91 
 
 		 832 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  29.44 
 
 		 714 aa  188  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.47 
 
 		 737 aa  187  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  29.91 
 
 		 779 aa  187  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  31.65 
 
 		 903 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  31.74 
 
 		 743 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.5 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  29.78 
 
 		 738 aa  184  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1092 aa  184  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  28.55 
 
 		 796 aa  184  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  28.07 
 
 		 909 aa  184  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.29 
 
 		 745 aa  184  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  29.08 
 
 		 750 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.74 
 
 		 1095 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  29.62 
 
 		 736 aa  181  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>