More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1813 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  100 
 
 
743 aa  1406    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  59.21 
 
 
761 aa  790    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  52.63 
 
 
738 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  56.97 
 
 
757 aa  688    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  36.84 
 
 
740 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.68 
 
 
740 aa  361  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  39.12 
 
 
738 aa  359  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  38.62 
 
 
731 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  36.43 
 
 
766 aa  347  7e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  34.16 
 
 
758 aa  337  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.94 
 
 
710 aa  324  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  36.39 
 
 
733 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  39.86 
 
 
762 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  35.55 
 
 
796 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 
751 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.74 
 
 
805 aa  313  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.93 
 
 
724 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  39.39 
 
 
717 aa  310  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  33.25 
 
 
769 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  33.25 
 
 
769 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  33.86 
 
 
741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  34.07 
 
 
736 aa  304  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  38.23 
 
 
783 aa  300  9e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.9 
 
 
770 aa  299  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  34.31 
 
 
839 aa  297  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.85 
 
 
1155 aa  296  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  35.01 
 
 
748 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.8 
 
 
1308 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  35.01 
 
 
754 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.05 
 
 
740 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  37.56 
 
 
709 aa  283  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  36.73 
 
 
767 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.85 
 
 
846 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  36.6 
 
 
767 aa  281  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  36.6 
 
 
767 aa  281  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.18 
 
 
743 aa  280  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  34.52 
 
 
738 aa  280  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  32.47 
 
 
738 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  34.82 
 
 
731 aa  277  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.97 
 
 
1095 aa  273  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  37.13 
 
 
727 aa  271  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  33.74 
 
 
953 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.76 
 
 
741 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.18 
 
 
944 aa  262  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  30.87 
 
 
1013 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.96 
 
 
723 aa  257  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.35 
 
 
730 aa  257  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  32.07 
 
 
778 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.08 
 
 
730 aa  255  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  29.64 
 
 
730 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  29.86 
 
 
730 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.22 
 
 
730 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.69 
 
 
730 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.69 
 
 
730 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.69 
 
 
730 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.69 
 
 
704 aa  252  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.32 
 
 
730 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.59 
 
 
730 aa  251  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  31.4 
 
 
997 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.82 
 
 
829 aa  247  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.82 
 
 
829 aa  247  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.97 
 
 
743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  30.22 
 
 
729 aa  242  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.62 
 
 
715 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.79 
 
 
728 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.65 
 
 
734 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  37.14 
 
 
745 aa  231  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  30.03 
 
 
772 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  30.03 
 
 
772 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  30.03 
 
 
772 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  36.4 
 
 
731 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  32.5 
 
 
737 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.51 
 
 
718 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  34.84 
 
 
832 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.46 
 
 
723 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.23 
 
 
743 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.82 
 
 
966 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.8 
 
 
979 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.62 
 
 
983 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.62 
 
 
983 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.37 
 
 
717 aa  225  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  33.09 
 
 
743 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  31.27 
 
 
735 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  35.56 
 
 
737 aa  224  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 
793 aa  224  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  31.6 
 
 
735 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 
734 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.69 
 
 
978 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.23 
 
 
726 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.23 
 
 
724 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  33.27 
 
 
787 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  31.76 
 
 
876 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.23 
 
 
741 aa  214  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.86 
 
 
743 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.4 
 
 
729 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  30.48 
 
 
847 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.58 
 
 
758 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  32.29 
 
 
724 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  37.68 
 
 
732 aa  211  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.17 
 
 
735 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>