More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3334 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  100 
 
 
729 aa  1413    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  70.75 
 
 
735 aa  978    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.61 
 
 
743 aa  491  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  40.95 
 
 
717 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  40.5 
 
 
752 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39.97 
 
 
758 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  39.11 
 
 
832 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  42.46 
 
 
734 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  40.86 
 
 
731 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.3 
 
 
732 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.66 
 
 
735 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  37.83 
 
 
742 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.38 
 
 
760 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.83 
 
 
842 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 
829 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 
829 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  40.29 
 
 
761 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  38.55 
 
 
737 aa  399  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  39.13 
 
 
718 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  38.81 
 
 
728 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  38.66 
 
 
734 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  39.46 
 
 
723 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  37.21 
 
 
737 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.58 
 
 
735 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  37.85 
 
 
735 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  38.26 
 
 
793 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.12 
 
 
734 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.52 
 
 
726 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  39.88 
 
 
751 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  38.73 
 
 
715 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  37.07 
 
 
755 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.85 
 
 
704 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  40.5 
 
 
724 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  39.32 
 
 
723 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.24 
 
 
724 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  41.32 
 
 
743 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  35.06 
 
 
917 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.51 
 
 
796 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  34.06 
 
 
920 aa  363  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  35.8 
 
 
732 aa  362  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  38.32 
 
 
1058 aa  362  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  35.69 
 
 
787 aa  360  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.12 
 
 
779 aa  357  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  37.46 
 
 
714 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.92 
 
 
1382 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  33.85 
 
 
909 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.13 
 
 
750 aa  346  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.41 
 
 
781 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.38 
 
 
746 aa  341  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32 
 
 
893 aa  340  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.24 
 
 
740 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.06 
 
 
749 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  35.72 
 
 
732 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  33.08 
 
 
779 aa  331  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  37.03 
 
 
903 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  35.36 
 
 
1002 aa  324  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.68 
 
 
737 aa  319  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  35.3 
 
 
734 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.24 
 
 
711 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  31.85 
 
 
772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  31.85 
 
 
772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  31.85 
 
 
772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  35.18 
 
 
854 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  35.29 
 
 
1092 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  33.95 
 
 
807 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  34.34 
 
 
843 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 
787 aa  298  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  45.19 
 
 
876 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  34.38 
 
 
729 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 
784 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.16 
 
 
978 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  35.57 
 
 
903 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  34.04 
 
 
840 aa  283  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  31.5 
 
 
791 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.05 
 
 
726 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  37.35 
 
 
726 aa  270  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.78 
 
 
737 aa  269  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  45.86 
 
 
776 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.8 
 
 
979 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  33.66 
 
 
738 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.62 
 
 
983 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.62 
 
 
983 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.64 
 
 
968 aa  263  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 
846 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.68 
 
 
743 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  41.13 
 
 
958 aa  248  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31.96 
 
 
751 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  28.71 
 
 
718 aa  233  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.68 
 
 
966 aa  232  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.16 
 
 
730 aa  231  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.9 
 
 
745 aa  230  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.07 
 
 
730 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.89 
 
 
730 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.07 
 
 
730 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.07 
 
 
730 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.57 
 
 
730 aa  229  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.76 
 
 
730 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  48.45 
 
 
841 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.59 
 
 
740 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  28.46 
 
 
733 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>