More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5231 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  100 
 
 
772 aa  1519    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  51.92 
 
 
784 aa  685    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  50.19 
 
 
779 aa  677    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
772 aa  1519    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  99.87 
 
 
772 aa  1518    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  57.07 
 
 
787 aa  752    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  44.9 
 
 
832 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  44.97 
 
 
728 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.52 
 
 
734 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  44.29 
 
 
731 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  44.43 
 
 
755 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  43.42 
 
 
735 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  40.75 
 
 
840 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  40.6 
 
 
779 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  41.65 
 
 
793 aa  482  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.44 
 
 
724 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  42.53 
 
 
735 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.29 
 
 
920 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  41.51 
 
 
843 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  42.6 
 
 
734 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  42.75 
 
 
723 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.01 
 
 
829 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.01 
 
 
829 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  40.91 
 
 
791 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  40.41 
 
 
909 aa  462  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  38.25 
 
 
787 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  40.76 
 
 
917 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  38.74 
 
 
732 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  38.09 
 
 
854 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  39.9 
 
 
1002 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.89 
 
 
893 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.92 
 
 
1092 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.94 
 
 
1382 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.93 
 
 
742 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  40.66 
 
 
734 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  42.46 
 
 
958 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  40.77 
 
 
729 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  39.89 
 
 
903 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  33.9 
 
 
743 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  46.61 
 
 
726 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.77 
 
 
746 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  40.5 
 
 
903 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  35.11 
 
 
842 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  37.66 
 
 
1058 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.23 
 
 
704 aa  355  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  40.66 
 
 
738 aa  354  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  39.59 
 
 
807 aa  353  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  32.86 
 
 
760 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.06 
 
 
735 aa  351  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  41.02 
 
 
732 aa  347  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 
752 aa  346  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.88 
 
 
732 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.77 
 
 
717 aa  345  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.97 
 
 
758 aa  343  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  34.67 
 
 
718 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.76 
 
 
751 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.33 
 
 
737 aa  336  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.82 
 
 
876 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.89 
 
 
729 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  40.46 
 
 
726 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 
715 aa  324  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.91 
 
 
735 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.58 
 
 
723 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  37.8 
 
 
737 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.35 
 
 
761 aa  310  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.33 
 
 
749 aa  305  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  36.46 
 
 
781 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.47 
 
 
726 aa  296  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.13 
 
 
740 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33 
 
 
750 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 
711 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.98 
 
 
714 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.06 
 
 
743 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.97 
 
 
724 aa  277  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.5 
 
 
796 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.27 
 
 
983 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.27 
 
 
983 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  36.84 
 
 
836 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.45 
 
 
979 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.29 
 
 
968 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.72 
 
 
978 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.28 
 
 
743 aa  227  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.42 
 
 
966 aa  225  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.68 
 
 
758 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.56 
 
 
743 aa  221  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.12 
 
 
738 aa  218  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  34.27 
 
 
741 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.4 
 
 
730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.4 
 
 
730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.4 
 
 
730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.23 
 
 
730 aa  214  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.1 
 
 
730 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.4 
 
 
846 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.62 
 
 
730 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.45 
 
 
730 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.75 
 
 
730 aa  210  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.15 
 
 
737 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.99 
 
 
757 aa  210  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.03 
 
 
730 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.19 
 
 
730 aa  209  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>