More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3645 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 781 aa  1567    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  45.17 
 
 		 735 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  43.98 
 
 		 752 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  41.37 
 
 		 760 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  41.22 
 
 		 737 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  42.61 
 
 		 758 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 842 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  37.67 
 
 		 717 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  37.04 
 
 		 749 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  35.25 
 
 		 743 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  37.93 
 
 		 718 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.05 
 
 		 726 aa  396  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  32.79 
 
 		 829 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  32.79 
 
 		 829 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.86 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  35.59 
 
 		 731 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.42 
 
 		 732 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.29 
 
 		 729 aa  349  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.67 
 
 		 876 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  33.38 
 
 		 734 aa  344  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  33.33 
 
 		 728 aa  342  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 		 751 aa  339  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.54 
 
 		 893 aa  337  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  36.11 
 
 		 737 aa  337  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.88 
 
 		 832 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  31.01 
 
 		 920 aa  334  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.86 
 
 		 735 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  34.28 
 
 		 742 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.97 
 
 		 723 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.24 
 
 		 761 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  34.27 
 
 		 1058 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  33.42 
 
 		 735 aa  324  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.57 
 
 		 723 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  33.55 
 
 		 755 aa  320  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.44 
 
 		 704 aa  319  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 		 715 aa  319  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1092 aa  318  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  33.96 
 
 		 793 aa  318  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  34.38 
 
 		 734 aa  317  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  31.76 
 
 		 787 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  35.85 
 
 		 854 aa  313  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  33.69 
 
 		 734 aa  310  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  30.3 
 
 		 779 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  31.62 
 
 		 772 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  31.62 
 
 		 772 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  31.62 
 
 		 772 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  36.28 
 
 		 740 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.1 
 
 		 743 aa  307  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  32.23 
 
 		 909 aa  305  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  32.84 
 
 		 732 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  34.19 
 
 		 735 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  33.51 
 
 		 1002 aa  302  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.34 
 
 		 917 aa  301  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.89 
 
 		 746 aa  294  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.39 
 
 		 758 aa  293  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  37.15 
 
 		 724 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.87 
 
 		 750 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.66 
 
 		 1382 aa  285  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  31.34 
 
 		 779 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  34.04 
 
 		 958 aa  282  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.52 
 
 		 714 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.71 
 
 		 805 aa  277  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  31.32 
 
 		 791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  33.57 
 
 		 729 aa  274  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 711 aa  273  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  32.56 
 
 		 843 aa  273  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  31.56 
 
 		 807 aa  270  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  35.48 
 
 		 840 aa  268  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.66 
 
 		 983 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.66 
 
 		 983 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.66 
 
 		 979 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.78 
 
 		 740 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  35.81 
 
 		 903 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  29.61 
 
 		 731 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  32.01 
 
 		 732 aa  255  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  34.79 
 
 		 787 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.85 
 
 		 978 aa  252  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.9 
 
 		 738 aa  251  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.33 
 
 		 733 aa  250  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  32.61 
 
 		 737 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.02 
 
 		 968 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 726 aa  246  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  30.78 
 
 		 717 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 846 aa  244  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.61 
 
 		 737 aa  241  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.7 
 
 		 741 aa  240  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.3 
 
 		 766 aa  239  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  30.58 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  34.21 
 
 		 784 aa  238  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  26.73 
 
 		 710 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.89 
 
 		 743 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.88 
 
 		 1308 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  41.16 
 
 		 776 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.72 
 
 		 736 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 		 738 aa  234  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  26.92 
 
 		 1155 aa  234  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  29.84 
 
 		 745 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  27.31 
 
 		 751 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.65 
 
 		 741 aa  231  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  34.77 
 
 		 903 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>