More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0651 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
876 aa  1677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  71.07 
 
 
751 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  58.43 
 
 
732 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  55.43 
 
 
715 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  42.78 
 
 
711 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.78 
 
 
743 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  42.68 
 
 
723 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  40.66 
 
 
842 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  41.24 
 
 
731 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  38.94 
 
 
728 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  39.38 
 
 
737 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  40.13 
 
 
735 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  39.68 
 
 
832 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  38.06 
 
 
758 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.24 
 
 
735 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  37.69 
 
 
760 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  38.88 
 
 
755 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  38.35 
 
 
752 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  38.84 
 
 
732 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.76 
 
 
729 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  36.57 
 
 
920 aa  399  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  39.55 
 
 
917 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  40.27 
 
 
735 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  37.65 
 
 
734 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  38 
 
 
717 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.26 
 
 
735 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.08 
 
 
726 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  40.03 
 
 
737 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  37.62 
 
 
742 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  39.01 
 
 
723 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  38.89 
 
 
793 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  39.03 
 
 
734 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  31.94 
 
 
829 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  31.94 
 
 
829 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  34.85 
 
 
787 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  35.79 
 
 
909 aa  356  8.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  39.95 
 
 
724 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.5 
 
 
743 aa  354  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  39.45 
 
 
761 aa  353  8e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  33.04 
 
 
779 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.92 
 
 
779 aa  340  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  37.77 
 
 
1002 aa  337  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  38.64 
 
 
750 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  37.55 
 
 
740 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.82 
 
 
772 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.82 
 
 
772 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.82 
 
 
772 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  37.71 
 
 
714 aa  333  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.2 
 
 
781 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  31.37 
 
 
893 aa  328  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.82 
 
 
718 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  37.52 
 
 
732 aa  327  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.7 
 
 
1382 aa  327  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  37.08 
 
 
854 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  37.35 
 
 
734 aa  318  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  36.45 
 
 
807 aa  318  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  38.51 
 
 
724 aa  318  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  38.52 
 
 
903 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  36.01 
 
 
1058 aa  303  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  34.73 
 
 
1092 aa  303  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  34.19 
 
 
729 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.37 
 
 
746 aa  301  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.87 
 
 
749 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  30.33 
 
 
704 aa  291  5.0000000000000004e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  37.04 
 
 
903 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  37.31 
 
 
734 aa  288  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.17 
 
 
979 aa  287  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.17 
 
 
983 aa  287  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.17 
 
 
983 aa  287  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  35.13 
 
 
958 aa  286  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  36.55 
 
 
784 aa  285  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  31.93 
 
 
791 aa  284  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.46 
 
 
726 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.17 
 
 
787 aa  280  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35 
 
 
978 aa  279  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  34.69 
 
 
737 aa  278  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.98 
 
 
968 aa  277  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.32 
 
 
743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  34.83 
 
 
840 aa  275  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  35.02 
 
 
843 aa  273  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  48.09 
 
 
776 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  35.65 
 
 
966 aa  262  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  36.5 
 
 
726 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  53.79 
 
 
796 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.45 
 
 
740 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.6 
 
 
846 aa  253  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  36.49 
 
 
766 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  33.96 
 
 
738 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.26 
 
 
758 aa  250  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.58 
 
 
741 aa  249  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.53 
 
 
743 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.42 
 
 
761 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.7 
 
 
733 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.04 
 
 
738 aa  233  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.89 
 
 
736 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  31.96 
 
 
718 aa  226  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  32.29 
 
 
743 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.55 
 
 
730 aa  221  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.29 
 
 
770 aa  220  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  33.19 
 
 
718 aa  217  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>