More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0245 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  100 
 
 		 893 aa  1818    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  59.35 
 
 		 829 aa  979    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  59.35 
 
 		 829 aa  979    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  37 
 
 		 704 aa  475  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  37.36 
 
 		 723 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  35.18 
 
 		 787 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  37.23 
 
 		 832 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  38.42 
 
 		 734 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  37.63 
 
 		 755 aa  456  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  36.1 
 
 		 731 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  37.24 
 
 		 728 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  37.33 
 
 		 737 aa  443  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  34.35 
 
 		 920 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  35.47 
 
 		 779 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  33.89 
 
 		 772 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 		 772 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  36 
 
 		 909 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 		 772 aa  436  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  36.88 
 
 		 735 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.06 
 
 		 735 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  33.25 
 
 		 1002 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.34 
 
 		 1382 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  37.09 
 
 		 734 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  39.51 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  35.94 
 
 		 793 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  35.8 
 
 		 734 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.81 
 
 		 917 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  34.14 
 
 		 779 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  34.89 
 
 		 732 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  36.86 
 
 		 724 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  38.8 
 
 		 840 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  32.6 
 
 		 743 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.19 
 
 		 746 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  34.12 
 
 		 791 aa  393  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  38.21 
 
 		 843 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  36.55 
 
 		 1092 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.97 
 
 		 742 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.69 
 
 		 842 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  34.49 
 
 		 1058 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  36.68 
 
 		 729 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  33.29 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  35.82 
 
 		 903 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.25 
 
 		 735 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.26 
 
 		 717 aa  360  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.32 
 
 		 749 aa  358  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.5 
 
 		 726 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32 
 
 		 729 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  35.77 
 
 		 958 aa  354  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  32.78 
 
 		 761 aa  347  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  33.97 
 
 		 784 aa  347  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.18 
 
 		 718 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  35.72 
 
 		 903 aa  340  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  30.63 
 
 		 723 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.53 
 
 		 781 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 		 752 aa  334  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  30.2 
 
 		 760 aa  333  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.35 
 
 		 735 aa  332  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.07 
 
 		 787 aa  332  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  31.75 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.26 
 
 		 726 aa  328  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.97 
 
 		 740 aa  327  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  30 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.28 
 
 		 711 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.56 
 
 		 714 aa  323  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  28.34 
 
 		 737 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  32.28 
 
 		 732 aa  319  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  30.68 
 
 		 715 aa  318  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  31.1 
 
 		 876 aa  318  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  30.83 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  33.11 
 
 		 738 aa  303  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  30.96 
 
 		 743 aa  303  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.39 
 
 		 796 aa  296  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  34.91 
 
 		 726 aa  296  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  32.7 
 
 		 737 aa  293  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  28.34 
 
 		 750 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.14 
 
 		 724 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.54 
 
 		 730 aa  280  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.87 
 
 		 730 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27 
 
 		 730 aa  274  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.87 
 
 		 730 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.87 
 
 		 730 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.87 
 
 		 730 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.96 
 
 		 979 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.15 
 
 		 983 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.15 
 
 		 983 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.79 
 
 		 730 aa  271  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.4 
 
 		 730 aa  270  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.93 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.26 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.41 
 
 		 758 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.26 
 
 		 740 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.85 
 
 		 729 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  28.36 
 
 		 718 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  27.72 
 
 		 736 aa  237  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  24.52 
 
 		 966 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  30.17 
 
 		 836 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  26.53 
 
 		 770 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  26.68 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  28.6 
 
 		 978 aa  233  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  27.79 
 
 		 741 aa  233  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>