More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5740 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 903 aa  1758    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  76.94 
 
 		 903 aa  1229    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  47.84 
 
 		 909 aa  668    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  50 
 
 		 917 aa  724    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  53.43 
 
 		 1002 aa  727    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  46.85 
 
 		 920 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  47.86 
 
 		 734 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  46.33 
 
 		 737 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  47.1 
 
 		 832 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  46.64 
 
 		 755 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  46.81 
 
 		 731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  46.13 
 
 		 728 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  47.57 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  46.42 
 
 		 723 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  44.23 
 
 		 735 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  44.04 
 
 		 735 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  43.9 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  42.82 
 
 		 793 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  40.21 
 
 		 779 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  42.65 
 
 		 734 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  39.97 
 
 		 772 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  40.29 
 
 		 742 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 772 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 772 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  42.9 
 
 		 729 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  44.15 
 
 		 734 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.93 
 
 		 829 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  40.71 
 
 		 779 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.93 
 
 		 829 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.84 
 
 		 732 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  35.22 
 
 		 893 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  46.04 
 
 		 843 aa  416  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.97 
 
 		 743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  45.83 
 
 		 726 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  43.03 
 
 		 840 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  45 
 
 		 738 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.24 
 
 		 842 aa  396  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.76 
 
 		 746 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  43.26 
 
 		 958 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.87 
 
 		 704 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  40 
 
 		 1058 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  41.34 
 
 		 854 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  40.67 
 
 		 807 aa  379  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  36.57 
 
 		 791 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  37.67 
 
 		 752 aa  366  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.52 
 
 		 1382 aa  363  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.16 
 
 		 729 aa  361  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.97 
 
 		 735 aa  359  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.95 
 
 		 718 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.71 
 
 		 717 aa  356  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  37.63 
 
 		 876 aa  356  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  41.22 
 
 		 732 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.92 
 
 		 796 aa  354  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1092 aa  353  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.77 
 
 		 758 aa  352  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.03 
 
 		 715 aa  352  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  47.15 
 
 		 726 aa  352  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  38.54 
 
 		 787 aa  351  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.68 
 
 		 732 aa  350  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  36.5 
 
 		 723 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  36.41 
 
 		 735 aa  347  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.32 
 
 		 760 aa  335  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  40.05 
 
 		 737 aa  334  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.44 
 
 		 751 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.48 
 
 		 737 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.77 
 
 		 711 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.64 
 
 		 726 aa  312  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 749 aa  312  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.65 
 
 		 740 aa  302  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.44 
 
 		 761 aa  299  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  37.62 
 
 		 743 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.89 
 
 		 781 aa  284  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.58 
 
 		 724 aa  283  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.05 
 
 		 750 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  35.93 
 
 		 714 aa  276  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  34.76 
 
 		 734 aa  258  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  32.49 
 
 		 836 aa  251  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.25 
 
 		 758 aa  244  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.6 
 
 		 743 aa  237  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.49 
 
 		 738 aa  234  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.86 
 
 		 740 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.96 
 
 		 766 aa  229  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.08 
 
 		 709 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  31.92 
 
 		 737 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30 
 
 		 741 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.36 
 
 		 979 aa  218  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.16 
 
 		 770 aa  217  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.06 
 
 		 751 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.66 
 
 		 736 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.09 
 
 		 983 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.09 
 
 		 983 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.29 
 
 		 805 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.22 
 
 		 733 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  29.61 
 
 		 738 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  24.79 
 
 		 730 aa  213  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.44 
 
 		 740 aa  212  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  24.5 
 
 		 730 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.02 
 
 		 730 aa  210  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.63 
 
 		 741 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>