More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0955 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  100 
 
 		 709 aa  1383    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.42 
 
 		 738 aa  356  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.15 
 
 		 761 aa  351  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  35.94 
 
 		 770 aa  340  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  35.37 
 
 		 751 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  34.68 
 
 		 769 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  34.68 
 
 		 769 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  38.02 
 
 		 743 aa  333  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 		 766 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  36.28 
 
 		 796 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  34.22 
 
 		 741 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  36.59 
 
 		 757 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  35.76 
 
 		 733 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  37.04 
 
 		 738 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.36 
 
 		 724 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.83 
 
 		 717 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 740 aa  316  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  37.36 
 
 		 783 aa  312  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.85 
 
 		 717 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  34.62 
 
 		 758 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  35.06 
 
 		 710 aa  309  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  34.43 
 
 		 767 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  34.56 
 
 		 767 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  34.56 
 
 		 767 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  38.69 
 
 		 762 aa  306  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  35.29 
 
 		 738 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 1155 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  34.64 
 
 		 731 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.94 
 
 		 743 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  37.01 
 
 		 805 aa  301  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  34.44 
 
 		 748 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  34.44 
 
 		 754 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  36.88 
 
 		 727 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  36.29 
 
 		 736 aa  296  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.36 
 
 		 740 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.24 
 
 		 740 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.87 
 
 		 741 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  34.46 
 
 		 839 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.51 
 
 		 1308 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  33.69 
 
 		 953 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  37.3 
 
 		 731 aa  283  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  33.77 
 
 		 778 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  35.06 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  32.6 
 
 		 738 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.92 
 
 		 743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 		 793 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  34.16 
 
 		 734 aa  273  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  35.89 
 
 		 723 aa  273  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  33.8 
 
 		 728 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  33.8 
 
 		 737 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  35.55 
 
 		 731 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.14 
 
 		 718 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.93 
 
 		 735 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  31.2 
 
 		 997 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.89 
 
 		 842 aa  261  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.34 
 
 		 704 aa  260  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.43 
 
 		 966 aa  258  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.34 
 
 		 1095 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  34.9 
 
 		 832 aa  257  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.44 
 
 		 737 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.15 
 
 		 781 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  34.11 
 
 		 735 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 		 846 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.61 
 
 		 730 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.61 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.61 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.61 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.6 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.35 
 
 		 745 aa  250  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.35 
 
 		 729 aa  250  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.88 
 
 		 743 aa  250  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.2 
 
 		 730 aa  250  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.5 
 
 		 726 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.34 
 
 		 730 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.52 
 
 		 729 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  33.69 
 
 		 787 aa  248  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.03 
 
 		 735 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.7 
 
 		 979 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.51 
 
 		 983 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  32.27 
 
 		 735 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.51 
 
 		 983 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  27.99 
 
 		 1013 aa  244  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  33.52 
 
 		 903 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.58 
 
 		 730 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.3 
 
 		 730 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.41 
 
 		 711 aa  243  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  33.58 
 
 		 724 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.42 
 
 		 724 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.58 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  31.64 
 
 		 758 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  30.64 
 
 		 779 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  34.36 
 
 		 755 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.42 
 
 		 732 aa  238  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.57 
 
 		 752 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.52 
 
 		 736 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  30.66 
 
 		 760 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.02 
 
 		 829 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.02 
 
 		 829 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.53 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.28 
 
 		 944 aa  234  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>