More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 737 aa  1422    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  50.66 
 
 		 807 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  52.73 
 
 		 732 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  44.38 
 
 		 728 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  44.19 
 
 		 755 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  44.14 
 
 		 731 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  46.39 
 
 		 1058 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.75 
 
 		 734 aa  476  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  43.62 
 
 		 723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  44.69 
 
 		 734 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  44.21 
 
 		 729 aa  452  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  41.11 
 
 		 832 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  41.07 
 
 		 734 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 793 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  41.62 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  41.99 
 
 		 735 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  42.95 
 
 		 724 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  41.7 
 
 		 735 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  45.34 
 
 		 726 aa  422  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  37.01 
 
 		 779 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  44.63 
 
 		 738 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  42.26 
 
 		 1002 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.32 
 
 		 920 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  39.43 
 
 		 779 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  39.25 
 
 		 909 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  39 
 
 		 787 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  36.88 
 
 		 704 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.95 
 
 		 829 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  45.68 
 
 		 726 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.95 
 
 		 829 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  36.33 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  36.33 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.59 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  36.38 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  37.6 
 
 		 743 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.22 
 
 		 1382 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  39.46 
 
 		 732 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.97 
 
 		 742 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  38.06 
 
 		 917 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  35.72 
 
 		 760 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  37.39 
 
 		 791 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.51 
 
 		 752 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.18 
 
 		 842 aa  365  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.42 
 
 		 746 aa  364  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.15 
 
 		 893 aa  362  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.17 
 
 		 735 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  44.48 
 
 		 1092 aa  357  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  36.51 
 
 		 737 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  41.25 
 
 		 854 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  37.67 
 
 		 958 aa  350  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  42.33 
 
 		 840 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  37.94 
 
 		 787 aa  347  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  42.44 
 
 		 843 aa  344  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  37.09 
 
 		 732 aa  343  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.69 
 
 		 735 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.54 
 
 		 758 aa  340  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  36.89 
 
 		 784 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.9 
 
 		 749 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  34.42 
 
 		 876 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  38.28 
 
 		 903 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.69 
 
 		 718 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.15 
 
 		 751 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.15 
 
 		 717 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  40.12 
 
 		 903 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.55 
 
 		 726 aa  307  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.41 
 
 		 715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.68 
 
 		 781 aa  297  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.67 
 
 		 723 aa  293  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  37.21 
 
 		 761 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  35.77 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.81 
 
 		 724 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.03 
 
 		 711 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.46 
 
 		 743 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.76 
 
 		 979 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.76 
 
 		 983 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.76 
 
 		 983 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.59 
 
 		 740 aa  263  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.43 
 
 		 968 aa  257  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.33 
 
 		 743 aa  256  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.85 
 
 		 978 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.61 
 
 		 750 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.69 
 
 		 737 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  32.52 
 
 		 733 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.05 
 
 		 966 aa  240  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.85 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.54 
 
 		 846 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  32.59 
 
 		 836 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  34.83 
 
 		 766 aa  228  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 805 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.85 
 
 		 738 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.05 
 
 		 717 aa  224  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.56 
 
 		 710 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  30.03 
 
 		 796 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.13 
 
 		 740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.13 
 
 		 741 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  30.73 
 
 		 761 aa  208  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.43 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.38 
 
 		 736 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  30.86 
 
 		 847 aa  200  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  30.45 
 
 		 745 aa  200  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>