More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4759 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  100 
 
 
805 aa  1597    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  46.01 
 
 
1308 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  46.57 
 
 
733 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  43.83 
 
 
717 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  41.34 
 
 
740 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  41.85 
 
 
731 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  41.04 
 
 
766 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  40 
 
 
738 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  36.62 
 
 
710 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.53 
 
 
758 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  39.49 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  35.12 
 
 
751 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  35.26 
 
 
770 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  34.18 
 
 
769 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  34.18 
 
 
769 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  35.78 
 
 
796 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.05 
 
 
724 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  34.92 
 
 
738 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  35.86 
 
 
741 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.49 
 
 
1095 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  34.99 
 
 
736 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.49 
 
 
944 aa  362  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  32.85 
 
 
741 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.91 
 
 
1155 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  35.05 
 
 
748 aa  356  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  35.33 
 
 
754 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.63 
 
 
743 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  31.4 
 
 
1013 aa  353  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.62 
 
 
740 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  35.55 
 
 
727 aa  350  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  33.07 
 
 
738 aa  347  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  34.62 
 
 
839 aa  343  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  35.58 
 
 
783 aa  340  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.52 
 
 
738 aa  331  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  34.18 
 
 
767 aa  330  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  34.18 
 
 
767 aa  330  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  34.18 
 
 
767 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.45 
 
 
997 aa  325  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  34.32 
 
 
778 aa  325  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  37.41 
 
 
757 aa  317  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  32.87 
 
 
953 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  37.58 
 
 
761 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  37.13 
 
 
743 aa  307  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  33.92 
 
 
731 aa  299  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  32.78 
 
 
743 aa  294  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 
846 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 
781 aa  286  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.72 
 
 
740 aa  281  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.81 
 
 
983 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.81 
 
 
983 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.26 
 
 
743 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.45 
 
 
979 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.37 
 
 
717 aa  275  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.99 
 
 
737 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.03 
 
 
842 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.22 
 
 
735 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.74 
 
 
730 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.6 
 
 
730 aa  265  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.6 
 
 
730 aa  265  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.6 
 
 
730 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.99 
 
 
709 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.2 
 
 
730 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.33 
 
 
730 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.87 
 
 
729 aa  261  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.78 
 
 
736 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.24 
 
 
730 aa  260  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.97 
 
 
723 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.06 
 
 
743 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.63 
 
 
978 aa  258  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.13 
 
 
730 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.68 
 
 
966 aa  257  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.63 
 
 
968 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.47 
 
 
714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.57 
 
 
730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.28 
 
 
726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.67 
 
 
730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.74 
 
 
758 aa  254  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.35 
 
 
761 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.33 
 
 
751 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.23 
 
 
715 aa  253  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 
752 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.46 
 
 
745 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.99 
 
 
796 aa  249  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.49 
 
 
758 aa  248  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.25 
 
 
741 aa  247  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  32.13 
 
 
745 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.64 
 
 
718 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.49 
 
 
723 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  35.28 
 
 
724 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.4 
 
 
734 aa  238  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.07 
 
 
740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.45 
 
 
704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.07 
 
 
743 aa  235  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  31 
 
 
632 aa  234  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.05 
 
 
829 aa  233  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.05 
 
 
829 aa  233  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.28 
 
 
732 aa  232  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.58 
 
 
711 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.95 
 
 
749 aa  231  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  31.68 
 
 
832 aa  231  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>