More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4966 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 758 aa  1483    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  36.64 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 846 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  37.93 
 
 		 743 aa  349  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  34.84 
 
 		 736 aa  343  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33 
 
 		 758 aa  326  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 743 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.49 
 
 		 979 aa  316  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.03 
 
 		 983 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.03 
 
 		 983 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.35 
 
 		 717 aa  314  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  36.02 
 
 		 978 aa  312  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.97 
 
 		 731 aa  310  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  33.01 
 
 		 735 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  33.74 
 
 		 745 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  36.65 
 
 		 966 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  36.3 
 
 		 968 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  34 
 
 		 738 aa  304  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.46 
 
 		 740 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  33.47 
 
 		 733 aa  297  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  32.34 
 
 		 737 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.01 
 
 		 718 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  34.1 
 
 		 727 aa  293  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.24 
 
 		 766 aa  293  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  34.71 
 
 		 744 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.33 
 
 		 732 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.98 
 
 		 735 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  36.33 
 
 		 741 aa  287  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  33.93 
 
 		 842 aa  286  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.89 
 
 		 741 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  32.65 
 
 		 738 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  33.51 
 
 		 770 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.45 
 
 		 781 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  33.7 
 
 		 752 aa  284  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  31.45 
 
 		 751 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.84 
 
 		 737 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.54 
 
 		 805 aa  281  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.33 
 
 		 738 aa  280  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.69 
 
 		 710 aa  279  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.89 
 
 		 717 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.85 
 
 		 769 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.85 
 
 		 769 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.53 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  34.07 
 
 		 741 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.13 
 
 		 1308 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.03 
 
 		 745 aa  274  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.04 
 
 		 743 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.02 
 
 		 1155 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  32.19 
 
 		 758 aa  272  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  32.94 
 
 		 847 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  32.28 
 
 		 794 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.06 
 
 		 730 aa  271  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.53 
 
 		 730 aa  271  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 737 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.82 
 
 		 730 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.86 
 
 		 723 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.92 
 
 		 749 aa  267  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.96 
 
 		 729 aa  266  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  33.75 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  35.37 
 
 		 761 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.03 
 
 		 740 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.63 
 
 		 711 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  33.06 
 
 		 715 aa  264  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  33.48 
 
 		 796 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  32.34 
 
 		 748 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  32.29 
 
 		 754 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.62 
 
 		 730 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.72 
 
 		 730 aa  261  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.26 
 
 		 730 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.9 
 
 		 751 aa  260  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.76 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.56 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.56 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.56 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  32.43 
 
 		 738 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.14 
 
 		 737 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 829 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 829 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  31.36 
 
 		 718 aa  258  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.11 
 
 		 724 aa  258  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.87 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  30.78 
 
 		 729 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.7 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.27 
 
 		 726 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  30.34 
 
 		 760 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.06 
 
 		 724 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  33.43 
 
 		 783 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  35.91 
 
 		 736 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  34.06 
 
 		 762 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.11 
 
 		 750 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  31.23 
 
 		 997 aa  251  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.66 
 
 		 734 aa  251  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  34.1 
 
 		 751 aa  250  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.81 
 
 		 832 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.28 
 
 		 704 aa  246  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  31.84 
 
 		 767 aa  245  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  31.84 
 
 		 767 aa  245  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  32.16 
 
 		 755 aa  243  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.88 
 
 		 731 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.92 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>