More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8829 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 1308 aa  2519    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  49.87 
 
 		 733 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  48.67 
 
 		 805 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  45.53 
 
 		 740 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  46.3 
 
 		 731 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  47.17 
 
 		 717 aa  526  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  43.35 
 
 		 766 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  42.09 
 
 		 738 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  38.35 
 
 		 710 aa  429  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  38.2 
 
 		 758 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  38.64 
 
 		 796 aa  396  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  36.93 
 
 		 770 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  36.1 
 
 		 741 aa  377  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  36.21 
 
 		 751 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  38.21 
 
 		 736 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  35.77 
 
 		 769 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  35.77 
 
 		 769 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.37 
 
 		 1095 aa  365  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  36.44 
 
 		 741 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  32.41 
 
 		 1013 aa  357  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.47 
 
 		 743 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  35.7 
 
 		 738 aa  355  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.95 
 
 		 740 aa  353  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  35.83 
 
 		 727 aa  352  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  36.03 
 
 		 748 aa  348  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 754 aa  348  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  35.77 
 
 		 783 aa  340  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.04 
 
 		 944 aa  337  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  36.75 
 
 		 839 aa  335  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  34.33 
 
 		 1155 aa  330  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  35.56 
 
 		 778 aa  324  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  36 
 
 		 953 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  34.2 
 
 		 738 aa  322  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  33.71 
 
 		 767 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  33.71 
 
 		 767 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.54 
 
 		 761 aa  303  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.53 
 
 		 730 aa  283  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.42 
 
 		 730 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  30.42 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  30.42 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  30.42 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  30.39 
 
 		 730 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  36.57 
 
 		 757 aa  271  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.19 
 
 		 730 aa  269  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  30.01 
 
 		 730 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  29.96 
 
 		 729 aa  264  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  35.81 
 
 		 737 aa  264  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  29.49 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  37.01 
 
 		 745 aa  263  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  37.64 
 
 		 814 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.7 
 
 		 730 aa  261  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.41 
 
 		 717 aa  251  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.46 
 
 		 740 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.65 
 
 		 978 aa  248  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  39.04 
 
 		 709 aa  247  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  30.91 
 
 		 704 aa  247  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.38 
 
 		 842 aa  246  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.77 
 
 		 752 aa  242  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.71 
 
 		 966 aa  241  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.28 
 
 		 781 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.86 
 
 		 741 aa  238  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.49 
 
 		 829 aa  238  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.49 
 
 		 829 aa  238  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.62 
 
 		 718 aa  227  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.64 
 
 		 736 aa  225  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  33.52 
 
 		 734 aa  223  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.54 
 
 		 714 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.92 
 
 		 749 aa  219  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34 
 
 		 740 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.48 
 
 		 893 aa  217  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  32.3 
 
 		 761 aa  211  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.98 
 
 		 832 aa  211  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.37 
 
 		 723 aa  208  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.28 
 
 		 711 aa  205  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  46.69 
 
 		 762 aa  204  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  32.42 
 
 		 632 aa  204  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31.19 
 
 		 751 aa  204  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  46.03 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  37.25 
 
 		 1110 aa  199  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  32.68 
 
 		 731 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  34.76 
 
 		 1093 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  48.34 
 
 		 773 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  34.76 
 
 		 1093 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.17 
 
 		 735 aa  195  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  32.09 
 
 		 728 aa  195  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  34.47 
 
 		 1089 aa  194  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  30.03 
 
 		 909 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  33.06 
 
 		 500 aa  193  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  31.14 
 
 		 779 aa  192  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.94 
 
 		 1382 aa  192  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  47.37 
 
 		 743 aa  191  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  33.11 
 
 		 767 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.6 
 
 		 724 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  32.19 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  29.09 
 
 		 920 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  40.73 
 
 		 846 aa  184  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  45.83 
 
 		 724 aa  184  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  32.25 
 
 		 787 aa  178  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  41.23 
 
 		 715 aa  178  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  28.42 
 
 		 997 aa  175  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>