209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11169 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  100 
 
 
361 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  62.68 
 
 
738 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  60.92 
 
 
769 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  60.92 
 
 
769 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  60.92 
 
 
751 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  62.37 
 
 
778 aa  328  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  58.8 
 
 
767 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  58.8 
 
 
767 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  58.8 
 
 
767 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  60 
 
 
743 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  56.12 
 
 
1155 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  58.85 
 
 
727 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  58.4 
 
 
748 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  58.4 
 
 
754 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  43.16 
 
 
738 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  43.75 
 
 
770 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  50 
 
 
731 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  41.43 
 
 
736 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  37.68 
 
 
953 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  38.6 
 
 
773 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  34.15 
 
 
741 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  37.01 
 
 
839 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  37.12 
 
 
762 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  38.05 
 
 
796 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.17 
 
 
1308 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.83 
 
 
710 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.25 
 
 
740 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.79 
 
 
733 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.4 
 
 
766 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  31.41 
 
 
805 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.44 
 
 
724 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.51 
 
 
717 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.22 
 
 
738 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.73 
 
 
731 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  36.14 
 
 
783 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  29.06 
 
 
632 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  31.7 
 
 
814 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  32.78 
 
 
718 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  28.42 
 
 
944 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.51 
 
 
740 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  32.72 
 
 
738 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.73 
 
 
741 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  28.67 
 
 
1089 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.3 
 
 
1095 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.14 
 
 
729 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.92 
 
 
730 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  28.67 
 
 
1093 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  28.67 
 
 
1093 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.97 
 
 
743 aa  99.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.55 
 
 
730 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.55 
 
 
730 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.55 
 
 
730 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.02 
 
 
730 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.55 
 
 
730 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.59 
 
 
730 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.63 
 
 
730 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  27.6 
 
 
1013 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.76 
 
 
730 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.04 
 
 
758 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  28.42 
 
 
1110 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  27.5 
 
 
743 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  28.1 
 
 
758 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  29.69 
 
 
909 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  31.18 
 
 
917 aa  93.6  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  30.36 
 
 
735 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  38.79 
 
 
730 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.47 
 
 
757 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  29.37 
 
 
832 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 
718 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.41 
 
 
761 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  28.32 
 
 
752 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.96 
 
 
743 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 
903 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.55 
 
 
735 aa  85.9  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.76 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  30.6 
 
 
744 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  31.48 
 
 
807 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  29.72 
 
 
793 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  25.36 
 
 
704 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  31.82 
 
 
736 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  29.72 
 
 
734 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.66 
 
 
997 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.86 
 
 
717 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1710  MMPL domain protein  29.88 
 
 
1050 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.84 
 
 
743 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.17 
 
 
746 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  28.04 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.39 
 
 
723 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  28.72 
 
 
841 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32.04 
 
 
893 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.17 
 
 
755 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  28.9 
 
 
724 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  29.67 
 
 
776 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
846 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  30.64 
 
 
840 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  35.34 
 
 
779 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.32 
 
 
829 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.32 
 
 
829 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.46 
 
 
734 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  28.4 
 
 
903 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>