More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0144 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  73.86 
 
 		 718 aa  959    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 718 aa  1401    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  33.74 
 
 		 743 aa  314  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.35 
 
 		 829 aa  302  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.35 
 
 		 829 aa  302  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.23 
 
 		 732 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.27 
 
 		 704 aa  286  7e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.83 
 
 		 979 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.4 
 
 		 893 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.75 
 
 		 983 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.75 
 
 		 983 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.89 
 
 		 717 aa  273  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.87 
 
 		 714 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.74 
 
 		 710 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.71 
 
 		 758 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.08 
 
 		 978 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.24 
 
 		 723 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 		 740 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 735 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.49 
 
 		 729 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.57 
 
 		 751 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.42 
 
 		 718 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.82 
 
 		 761 aa  257  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.05 
 
 		 743 aa  257  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 		 876 aa  257  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.75 
 
 		 735 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.44 
 
 		 968 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.28 
 
 		 723 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 832 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30.82 
 
 		 842 aa  249  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.45 
 
 		 735 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.92 
 
 		 734 aa  247  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.05 
 
 		 966 aa  246  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.62 
 
 		 728 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.54 
 
 		 726 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.38 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.14 
 
 		 735 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  31.79 
 
 		 755 aa  245  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 		 715 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  32.3 
 
 		 736 aa  245  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.04 
 
 		 740 aa  244  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.97 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  30.94 
 
 		 751 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  30.1 
 
 		 793 aa  240  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  30.1 
 
 		 734 aa  240  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  32.31 
 
 		 796 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.46 
 
 		 752 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.83 
 
 		 1382 aa  237  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.83 
 
 		 711 aa  237  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  30.37 
 
 		 732 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.98 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.55 
 
 		 730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  26.87 
 
 		 741 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 846 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.48 
 
 		 724 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.9 
 
 		 758 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.5 
 
 		 730 aa  234  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.44 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.44 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  34.76 
 
 		 737 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  29.17 
 
 		 787 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.44 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.3 
 
 		 781 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.63 
 
 		 766 aa  231  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.44 
 
 		 730 aa  230  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  28.04 
 
 		 742 aa  230  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.16 
 
 		 730 aa  230  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.91 
 
 		 1155 aa  230  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.53 
 
 		 760 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  31.57 
 
 		 738 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  30.84 
 
 		 772 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  30.84 
 
 		 772 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.7 
 
 		 749 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  30.84 
 
 		 772 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  29.76 
 
 		 731 aa  227  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  30.08 
 
 		 741 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  30.45 
 
 		 737 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.28 
 
 		 738 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  30.72 
 
 		 724 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 779 aa  224  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.81 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.58 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  30.18 
 
 		 779 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.05 
 
 		 730 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.51 
 
 		 724 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  30.04 
 
 		 751 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  28.46 
 
 		 737 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  25.75 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.57 
 
 		 743 aa  218  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.93 
 
 		 770 aa  216  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  31.39 
 
 		 743 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  32.37 
 
 		 847 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  30.06 
 
 		 917 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  31.18 
 
 		 1002 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.17 
 
 		 746 aa  213  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.05 
 
 		 736 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  29.32 
 
 		 769 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  29.32 
 
 		 769 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  28.13 
 
 		 733 aa  210  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  29.35 
 
 		 734 aa  210  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>