53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2352 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2352  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 494 aa  994    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  32.94 
 
 		 510 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  31.03 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1066 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.25 
 
 		 395 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 782 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 730 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.27 
 
 		 572 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 918 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.68 
 
 		 292 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 798 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.74 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1089 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.56 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  26.74 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.59 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 		 697 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  24.56 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 814 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0794  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.07 
 
 		 724 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  27.17 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.67 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 888 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  23.42 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 		 1626 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 757 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 812 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 791 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 957 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  24.11 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 807 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.44 
 
 		 653 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  28.4 
 
 		 615 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  25.71 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.75 
 
 		 1684 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 760 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  22.18 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  22.97 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 794 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  27.12 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.3 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1075 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  28.57 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  27.34 
 
 		 439 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 		 902 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.62 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.98 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 		 810 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  31.25 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 806 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 776 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>