More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3484 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 367 aa  768    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  60.93 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  53.29 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  51.36 
 
 		 944 aa  338  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  50.58 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  35.01 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  32.31 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.62 
 
 		 567 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.52 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  27.54 
 
 		 572 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.64 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.87 
 
 		 430 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.81 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.23 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.45 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.17 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  30.23 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  29.07 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.8 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.45 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  29.65 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  29.39 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.77 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  26.92 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  26.34 
 
 		 615 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.8 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.33 
 
 		 667 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.24 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  26.72 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.47 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.42 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.14 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  29.02 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  27.18 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.54 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 969 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  30.34 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.48 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  26.54 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.32 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  21.86 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  26.74 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  34.03 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  23.57 
 
 		 435 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.94 
 
 		 717 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  23.91 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.86 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  25.62 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  25.24 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.7 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  22.12 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  26.18 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.88 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.91 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.67 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  23.84 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  23.84 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.35 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  26.94 
 
 		 450 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.1 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  21.63 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  25 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  23.16 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  24.5 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  27.55 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  24.04 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  26.11 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  26.11 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  25.85 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  29.1 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  22.61 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  25.81 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  22.86 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.73 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  23.6 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.73 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>