More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5038 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  100 
 
 		 944 aa  1900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  60.96 
 
 		 357 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  55.45 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  50.43 
 
 		 367 aa  340  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  50.79 
 
 		 379 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  34.37 
 
 		 598 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  39.3 
 
 		 623 aa  247  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.55 
 
 		 555 aa  233  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  39.64 
 
 		 674 aa  229  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  34.42 
 
 		 407 aa  184  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  33.64 
 
 		 354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.59 
 
 		 552 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.88 
 
 		 1103 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  33.68 
 
 		 574 aa  147  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  41.83 
 
 		 330 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  39.15 
 
 		 315 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.46 
 
 		 556 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  38.46 
 
 		 308 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.48 
 
 		 391 aa  131  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  29.3 
 
 		 529 aa  131  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.4 
 
 		 558 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.4 
 
 		 558 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.38 
 
 		 557 aa  129  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  29.8 
 
 		 558 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.75 
 
 		 539 aa  128  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  25.66 
 
 		 552 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.76 
 
 		 558 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.79 
 
 		 531 aa  128  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.61 
 
 		 528 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.37 
 
 		 549 aa  126  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.38 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.08 
 
 		 575 aa  125  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.84 
 
 		 557 aa  124  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.65 
 
 		 552 aa  124  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  30 
 
 		 542 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  33.82 
 
 		 323 aa  124  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  28.08 
 
 		 547 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  25.25 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.78 
 
 		 557 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.56 
 
 		 557 aa  121  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  29.24 
 
 		 553 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  26.95 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  27.77 
 
 		 551 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.14 
 
 		 540 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  29.86 
 
 		 558 aa  118  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.32 
 
 		 539 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  28.89 
 
 		 522 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.94 
 
 		 532 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.24 
 
 		 569 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.94 
 
 		 540 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.23 
 
 		 506 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.91 
 
 		 541 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  27.44 
 
 		 540 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  31 
 
 		 550 aa  114  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.82 
 
 		 549 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.27 
 
 		 541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.53 
 
 		 529 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  26.99 
 
 		 597 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.49 
 
 		 603 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  30.4 
 
 		 548 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  27.01 
 
 		 563 aa  111  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.39 
 
 		 541 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  26.95 
 
 		 537 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.88 
 
 		 503 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.44 
 
 		 529 aa  110  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.27 
 
 		 571 aa  109  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  28.42 
 
 		 532 aa  108  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.28 
 
 		 549 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  25.88 
 
 		 546 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  26.87 
 
 		 579 aa  106  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  34.53 
 
 		 342 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  28.18 
 
 		 552 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  28.18 
 
 		 552 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.7 
 
 		 550 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  30.6 
 
 		 567 aa  105  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  25.86 
 
 		 491 aa  104  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  37.69 
 
 		 309 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.31 
 
 		 533 aa  104  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.27 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  29.41 
 
 		 563 aa  103  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.36 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  28.09 
 
 		 555 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  28.67 
 
 		 550 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  26.78 
 
 		 528 aa  101  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  35.68 
 
 		 301 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.22 
 
 		 334 aa  99.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  28.17 
 
 		 552 aa  97.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  28.82 
 
 		 506 aa  95.9  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  28.14 
 
 		 551 aa  91.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.87 
 
 		 318 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  29.46 
 
 		 386 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  25.9 
 
 		 560 aa  88.2  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  28.83 
 
 		 384 aa  87.8  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  26.13 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  29.02 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  29.46 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  29.46 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  25.68 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.1 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  23.18 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>