More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4589 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  38.01 
 
 		 444 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.99 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.22 
 
 		 430 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  41.42 
 
 		 435 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.06 
 
 		 429 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  33.05 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  32.91 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  32.13 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.46 
 
 		 444 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  36.42 
 
 		 441 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  31.73 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  35.23 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  35.45 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  35 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.65 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.51 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  33.2 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  33.51 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.1 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.23 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.7 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.75 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.08 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  33.85 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  24.56 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.07 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  34.73 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.82 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  32.08 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.08 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  35.87 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  35.87 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.96 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  32.07 
 
 		 443 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 		 676 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  34.24 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  32.07 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.03 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.45 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  31.88 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.05 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  33.66 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.16 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.05 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  33.79 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  31.46 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  33.16 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  33.16 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.46 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.84 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  27.38 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  31.46 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.93 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  28.5 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  32.7 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.99 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.81 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  28.19 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  32.11 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  37.16 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.06 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.07 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  31.75 
 
 		 430 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.1 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  32.6 
 
 		 1042 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1042 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  26.91 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  33.04 
 
 		 1040 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  32.92 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  35.42 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>