84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1863 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  799    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  28.62 
 
 
561 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  29.44 
 
 
883 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.23 
 
 
831 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 
902 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.63 
 
 
579 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  28.43 
 
 
884 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.5 
 
 
522 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4208  hypothetical protein  39.77 
 
 
486 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.43 
 
 
848 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  41.67 
 
 
958 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1862  hypothetical protein  33.02 
 
 
234 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  25.93 
 
 
887 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  41.67 
 
 
777 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 
957 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  46.67 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  38.57 
 
 
787 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 
1066 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
479 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  40 
 
 
952 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  43.75 
 
 
294 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  34.25 
 
 
361 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  43.33 
 
 
627 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40.58 
 
 
930 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  42.03 
 
 
739 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  44.26 
 
 
1089 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  35 
 
 
1087 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 
988 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
547 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 
935 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  43.33 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  39.73 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 
749 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.72 
 
 
1501 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
1710 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  40 
 
 
676 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  31.68 
 
 
1126 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  36.07 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
468 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  40 
 
 
818 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  40.58 
 
 
668 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 
962 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  32.93 
 
 
833 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  31.68 
 
 
1122 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
1489 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.68 
 
 
869 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  31.68 
 
 
1120 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
760 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 
801 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 
748 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
735 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  37.5 
 
 
391 aa  46.6  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.33 
 
 
848 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  35.94 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 
816 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  38.03 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.68 
 
 
594 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  37.68 
 
 
919 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 
753 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 
522 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  40.3 
 
 
869 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  41.43 
 
 
1182 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 
918 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 
788 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  32.67 
 
 
1109 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  35.71 
 
 
697 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  36.99 
 
 
581 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.62 
 
 
709 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  39.13 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  38.33 
 
 
698 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  34.38 
 
 
799 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  31.96 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  27.66 
 
 
738 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  37.68 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  39.66 
 
 
488 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  39.13 
 
 
680 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  46.03 
 
 
135 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2352  fibronectin, type III domain-containing protein  31.25 
 
 
494 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 
897 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  37.21 
 
 
1374 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 
1054 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 
966 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
854 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 
920 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>