More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5333 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.07 
 
 
1626 aa  1162    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.14 
 
 
1267 aa  703    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.88 
 
 
1190 aa  821    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.1 
 
 
1609 aa  1181    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 
1046 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.01 
 
 
1623 aa  1140    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
1032 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.82 
 
 
1607 aa  1191    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.63 
 
 
1598 aa  1204    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.52 
 
 
1398 aa  1047    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.38 
 
 
1583 aa  1237    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.68 
 
 
1617 aa  1087    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  45.4 
 
 
972 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.99 
 
 
1547 aa  1191    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  47.78 
 
 
969 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1684 aa  3332    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
1078 aa  646    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  47.78 
 
 
969 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.81 
 
 
1599 aa  1088    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
897 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
965 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
973 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
1013 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
947 aa  569  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.86 
 
 
1553 aa  560  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  42.82 
 
 
1085 aa  543  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.75 
 
 
1510 aa  532  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  44.98 
 
 
1367 aa  512  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.41 
 
 
1823 aa  513  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  32.39 
 
 
1229 aa  510  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 
1020 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
1686 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 
1014 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
1005 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.28 
 
 
1711 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.8 
 
 
1236 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.73 
 
 
1357 aa  473  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.85 
 
 
1240 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1760 aa  442  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.78 
 
 
1557 aa  440  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  35.56 
 
 
1491 aa  423  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  41.08 
 
 
1552 aa  417  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
1831 aa  414  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.09 
 
 
1481 aa  409  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.55 
 
 
1163 aa  400  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  36.86 
 
 
1523 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.08 
 
 
1363 aa  387  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.27 
 
 
1652 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  36.71 
 
 
1789 aa  379  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.27 
 
 
1217 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.62 
 
 
1344 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  36.04 
 
 
1211 aa  362  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.75 
 
 
947 aa  361  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.45 
 
 
1656 aa  357  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
698 aa  348  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  37.25 
 
 
1161 aa  345  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  32.63 
 
 
1364 aa  344  9e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  37.06 
 
 
1161 aa  344  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  39.04 
 
 
1766 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  34.99 
 
 
1454 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.44 
 
 
1196 aa  337  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  32.08 
 
 
1193 aa  335  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  33.07 
 
 
1164 aa  331  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.71 
 
 
1334 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.45 
 
 
1868 aa  330  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  29.81 
 
 
1176 aa  329  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  30.52 
 
 
1474 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.03 
 
 
1262 aa  324  8e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.47 
 
 
1221 aa  323  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.99 
 
 
696 aa  323  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.44 
 
 
919 aa  322  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  35.73 
 
 
1214 aa  317  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.58 
 
 
1661 aa  316  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.54 
 
 
1076 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 
1304 aa  308  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.47 
 
 
1190 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.61 
 
 
1072 aa  300  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.2 
 
 
1858 aa  298  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  34.49 
 
 
1714 aa  298  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.88 
 
 
1901 aa  298  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.28 
 
 
1072 aa  298  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  36.13 
 
 
1100 aa  295  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.2 
 
 
1188 aa  294  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.5 
 
 
1443 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
1353 aa  293  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.9 
 
 
1348 aa  291  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.43 
 
 
924 aa  290  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.29 
 
 
1856 aa  290  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 
1807 aa  288  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.57 
 
 
1416 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.52 
 
 
1247 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.6 
 
 
1177 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  31.8 
 
 
505 aa  278  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.72 
 
 
930 aa  278  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  32.53 
 
 
1280 aa  274  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  29.84 
 
 
1264 aa  272  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.92 
 
 
1213 aa  272  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  29.84 
 
 
1264 aa  272  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 
1399 aa  271  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 
728 aa  269  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>