More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3099 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.76 
 
 
1267 aa  784    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.53 
 
 
1626 aa  1422    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52 
 
 
1609 aa  1393    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  51.89 
 
 
1583 aa  1435    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.59 
 
 
1623 aa  1155    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  51.82 
 
 
1607 aa  1412    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  46.66 
 
 
972 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.85 
 
 
1598 aa  1484    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1599 aa  3139    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.04 
 
 
1684 aa  1090    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.01 
 
 
1547 aa  1454    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.39 
 
 
1617 aa  1187    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  51.47 
 
 
1032 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  55.13 
 
 
1398 aa  1211    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
1078 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  49.6 
 
 
1046 aa  712    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
973 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.32 
 
 
1190 aa  992    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
1013 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
1005 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  46.08 
 
 
969 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 
897 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  45.96 
 
 
969 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  44.25 
 
 
1014 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 
965 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  44.61 
 
 
1020 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 
1085 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.19 
 
 
1686 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 
1711 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.49 
 
 
1236 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  36.13 
 
 
1357 aa  479  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 
1760 aa  476  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.4 
 
 
1363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.78 
 
 
1557 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.64 
 
 
1823 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.96 
 
 
1229 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  42.25 
 
 
1367 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.55 
 
 
1240 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
698 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.54 
 
 
1481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
1344 aa  406  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39.97 
 
 
1510 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  38.77 
 
 
1789 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.66 
 
 
1163 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.71 
 
 
1652 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  39.15 
 
 
1552 aa  394  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.76 
 
 
1553 aa  390  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  35.66 
 
 
1656 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  30.17 
 
 
1491 aa  373  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34.69 
 
 
1217 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.62 
 
 
1523 aa  362  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.35 
 
 
947 aa  361  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
1831 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.04 
 
 
1196 aa  357  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.92 
 
 
1474 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 
1334 aa  348  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.74 
 
 
696 aa  348  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  36.82 
 
 
1661 aa  339  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.33 
 
 
1221 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.83 
 
 
1714 aa  338  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  33.63 
 
 
1193 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  38.1 
 
 
1454 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  36.21 
 
 
1100 aa  329  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  33.88 
 
 
1364 aa  328  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 
1161 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 
1161 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.62 
 
 
1190 aa  325  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.8 
 
 
1211 aa  324  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.97 
 
 
1076 aa  322  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.73 
 
 
1016 aa  320  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 
1016 aa  320  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  37.2 
 
 
1766 aa  318  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.21 
 
 
1262 aa  317  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.58 
 
 
1176 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.11 
 
 
1072 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.97 
 
 
1072 aa  316  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  49.13 
 
 
947 aa  310  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.07 
 
 
1868 aa  308  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.6 
 
 
1164 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.56 
 
 
1348 aa  301  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.62 
 
 
1213 aa  301  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 
1247 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.35 
 
 
1188 aa  293  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.29 
 
 
1177 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.87 
 
 
919 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.86 
 
 
1807 aa  290  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.82 
 
 
1443 aa  289  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.1 
 
 
1901 aa  285  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.73 
 
 
930 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
1353 aa  281  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.18 
 
 
1304 aa  278  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.75 
 
 
1416 aa  276  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  53.71 
 
 
425 aa  269  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 
728 aa  268  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  29.1 
 
 
1699 aa  267  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.02 
 
 
924 aa  266  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 
1373 aa  263  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  27.61 
 
 
1657 aa  260  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  24.13 
 
 
1264 aa  258  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.13 
 
 
1264 aa  258  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>