More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4412 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  39.67 
 
 		 1177 aa  806    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  59.78 
 
 		 1164 aa  1451    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  41.28 
 
 		 1163 aa  843    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1161 aa  2391    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  40.53 
 
 		 1176 aa  841    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  41.52 
 
 		 1190 aa  889    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  43.23 
 
 		 1367 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  99.74 
 
 		 1161 aa  2387    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  37.53 
 
 		 1209 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  41.89 
 
 		 891 aa  633  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  42.9 
 
 		 1552 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1789 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  52.3 
 
 		 902 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  52.3 
 
 		 902 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1304 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  48.11 
 
 		 1477 aa  442  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.78 
 
 		 1686 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.15 
 
 		 947 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  36.43 
 
 		 1714 aa  420  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.41 
 
 		 1711 aa  419  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.17 
 
 		 1363 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.8 
 
 		 1652 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41 
 
 		 1481 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  41.24 
 
 		 1510 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.01 
 
 		 1661 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1553 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  37.19 
 
 		 1656 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  53.42 
 
 		 1914 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 		 1348 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.13 
 
 		 1557 aa  390  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  36.75 
 
 		 1831 aa  386  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  52.33 
 
 		 781 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.09 
 
 		 1236 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  50.83 
 
 		 1908 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35 
 
 		 1858 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.54 
 
 		 696 aa  366  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.55 
 
 		 1766 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  38.07 
 
 		 1229 aa  365  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  36.76 
 
 		 1193 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  36.61 
 
 		 1196 aa  357  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  48.63 
 
 		 2077 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  48.77 
 
 		 1932 aa  350  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 1221 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  37.86 
 
 		 1364 aa  348  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.95 
 
 		 1760 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.61 
 
 		 1583 aa  344  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 		 1684 aa  344  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.19 
 
 		 1598 aa  340  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  30.46 
 
 		 1373 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1190 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  52.4 
 
 		 335 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.56 
 
 		 1607 aa  337  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.82 
 
 		 1523 aa  335  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.2 
 
 		 1547 aa  330  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.45 
 
 		 1609 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.5 
 
 		 1617 aa  325  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  35.03 
 
 		 1188 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.66 
 
 		 1357 aa  320  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.58 
 
 		 1599 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.52 
 
 		 1217 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.33 
 
 		 1626 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.3 
 
 		 919 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1211 aa  310  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1474 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  34.84 
 
 		 1443 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.28 
 
 		 1901 aa  308  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 		 1264 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 		 1264 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  44.99 
 
 		 787 aa  308  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.06 
 
 		 1262 aa  305  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.61 
 
 		 1454 aa  303  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.81 
 
 		 1623 aa  301  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.71 
 
 		 1599 aa  300  8e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.24 
 
 		 1823 aa  299  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1491 aa  291  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.45 
 
 		 1208 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.11 
 
 		 924 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1807 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.72 
 
 		 1016 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.72 
 
 		 1016 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.81 
 
 		 1247 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.88 
 
 		 1213 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.13 
 
 		 1868 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.58 
 
 		 1344 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.36 
 
 		 930 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1214 aa  268  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.79 
 
 		 740 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.06 
 
 		 1267 aa  261  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.44 
 
 		 1416 aa  257  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.2 
 
 		 1240 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.08 
 
 		 1856 aa  257  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  30.28 
 
 		 608 aa  252  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.34 
 
 		 1398 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.85 
 
 		 1188 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  31.24 
 
 		 1100 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 565 aa  247  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.78 
 
 		 1280 aa  245  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  30.5 
 
 		 1399 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  29.6 
 
 		 728 aa  242  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.69 
 
 		 1004 aa  242  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>