More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1121 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 
608 aa  1189    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  47.6 
 
 
565 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  37.88 
 
 
1789 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.69 
 
 
1523 aa  347  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.56 
 
 
696 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.46 
 
 
1363 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.15 
 
 
1656 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.76 
 
 
1236 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  38.16 
 
 
1364 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.95 
 
 
1652 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.89 
 
 
1163 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.22 
 
 
947 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.33 
 
 
1686 aa  317  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.96 
 
 
1221 aa  316  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.06 
 
 
1711 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  36.13 
 
 
1510 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.67 
 
 
1481 aa  310  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  34.59 
 
 
1553 aa  307  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37.11 
 
 
1454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.08 
 
 
1193 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  33.76 
 
 
1661 aa  293  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.17 
 
 
1831 aa  291  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.4 
 
 
1557 aa  287  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  35.97 
 
 
1714 aa  287  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 
1760 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.6 
 
 
1196 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 
1367 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.36 
 
 
1188 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.17 
 
 
1348 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.81 
 
 
919 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.11 
 
 
1901 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.55 
 
 
1190 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 
1474 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  38.02 
 
 
1217 aa  266  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.97 
 
 
1552 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.63 
 
 
1609 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.62 
 
 
1161 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.62 
 
 
1161 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.42 
 
 
1807 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.68 
 
 
1247 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.9 
 
 
1262 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.55 
 
 
1599 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 
1213 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.84 
 
 
1357 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.61 
 
 
1177 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 
1190 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.02 
 
 
1176 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.52 
 
 
1766 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.68 
 
 
1607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.72 
 
 
1229 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.61 
 
 
930 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  31.88 
 
 
1209 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.71 
 
 
1211 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.1 
 
 
1598 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.71 
 
 
1304 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1164 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.68 
 
 
1684 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.4 
 
 
1208 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.54 
 
 
924 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.95 
 
 
1583 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.52 
 
 
1868 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.18 
 
 
1599 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.71 
 
 
1547 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  30.4 
 
 
1373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.26 
 
 
1443 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  32.39 
 
 
1280 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 
1188 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.89 
 
 
1626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.23 
 
 
1016 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.2 
 
 
1617 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.23 
 
 
1016 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
1311 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.16 
 
 
1623 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.53 
 
 
1242 aa  207  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.43 
 
 
1411 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.49 
 
 
344 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.12 
 
 
676 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.23 
 
 
677 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  34.13 
 
 
1858 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.47 
 
 
1416 aa  203  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.2 
 
 
344 aa  203  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.55 
 
 
1267 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.07 
 
 
1214 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  28.51 
 
 
505 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.64 
 
 
576 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.02 
 
 
1344 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 
1041 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.8 
 
 
740 aa  191  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.3 
 
 
1209 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.02 
 
 
1072 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 
1264 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 
1264 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.72 
 
 
1072 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.84 
 
 
1856 aa  187  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.14 
 
 
1039 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.34 
 
 
1823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  27.19 
 
 
728 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.61 
 
 
1878 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.21 
 
 
1484 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.2 
 
 
1240 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>