More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3489 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
1039 aa  2073    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  81.65 
 
 
1041 aa  1628    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.32 
 
 
1004 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.56 
 
 
696 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.82 
 
 
1363 aa  304  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 
1236 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.6 
 
 
1831 aa  302  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.14 
 
 
1652 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.38 
 
 
947 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.17 
 
 
1221 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.33 
 
 
1364 aa  290  9e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.88 
 
 
1163 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.34 
 
 
1510 aa  280  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.29 
 
 
1523 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.02 
 
 
1481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  31.12 
 
 
1454 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.66 
 
 
1553 aa  267  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.14 
 
 
1217 aa  263  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
1686 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.2 
 
 
1193 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.73 
 
 
1247 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  31.31 
 
 
1190 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.92 
 
 
1196 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.05 
 
 
1188 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.16 
 
 
1901 aa  251  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31.08 
 
 
1789 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 
1807 aa  244  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.07 
 
 
1357 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 
1474 aa  241  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.38 
 
 
930 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.15 
 
 
1557 aa  235  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33 
 
 
919 aa  235  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.48 
 
 
1213 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  31.26 
 
 
1714 aa  231  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.55 
 
 
1711 aa  231  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.32 
 
 
1262 aa  228  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.1 
 
 
1443 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.68 
 
 
1229 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 
1760 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  30.5 
 
 
1656 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.69 
 
 
1552 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.3 
 
 
1188 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.6 
 
 
1161 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  31.89 
 
 
1661 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.43 
 
 
1161 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.67 
 
 
1868 aa  207  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 
1211 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.48 
 
 
1280 aa  206  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.13 
 
 
1367 aa  204  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  39.16 
 
 
742 aa  202  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.46 
 
 
1348 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  38.75 
 
 
316 aa  201  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.08 
 
 
924 aa  201  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.91 
 
 
1609 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.73 
 
 
1208 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.48 
 
 
1176 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.39 
 
 
1766 aa  197  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.45 
 
 
1304 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.83 
 
 
1242 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.69 
 
 
1177 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.06 
 
 
1599 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 
1190 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.31 
 
 
344 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.36 
 
 
676 aa  188  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.69 
 
 
677 aa  186  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.98 
 
 
682 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.72 
 
 
1164 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.89 
 
 
1484 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.99 
 
 
1209 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  35.42 
 
 
344 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.99 
 
 
1214 aa  181  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  35.09 
 
 
316 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.5 
 
 
740 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.72 
 
 
1684 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.05 
 
 
608 aa  179  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.54 
 
 
630 aa  179  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  37 
 
 
434 aa  177  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.96 
 
 
1373 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  34.02 
 
 
317 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.23 
 
 
1858 aa  177  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 
577 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.85 
 
 
1330 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  38.94 
 
 
335 aa  176  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  27.92 
 
 
1427 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.9 
 
 
1626 aa  175  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
1311 aa  174  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 
1878 aa  174  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.66 
 
 
1583 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.79 
 
 
316 aa  173  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.77 
 
 
728 aa  173  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.76 
 
 
1399 aa  171  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.95 
 
 
1344 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.57 
 
 
1209 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  36.1 
 
 
316 aa  170  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.93 
 
 
1416 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 
1016 aa  169  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.15 
 
 
1607 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  35.07 
 
 
335 aa  167  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.7 
 
 
1598 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.84 
 
 
1617 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>