More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1325 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 
1484 aa  2938    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  59.21 
 
 
1280 aa  1185    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  36.07 
 
 
1523 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  34.42 
 
 
1454 aa  446  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.66 
 
 
728 aa  357  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.01 
 
 
1868 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.05 
 
 
1652 aa  341  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.82 
 
 
1163 aa  320  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.87 
 
 
1557 aa  304  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.85 
 
 
1363 aa  304  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.84 
 
 
696 aa  303  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.95 
 
 
1416 aa  300  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 
947 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
1831 aa  284  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.69 
 
 
1364 aa  279  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.72 
 
 
1236 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.13 
 
 
1510 aa  275  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 
1193 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.19 
 
 
1481 aa  270  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.78 
 
 
1211 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.52 
 
 
1221 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.39 
 
 
1553 aa  268  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.12 
 
 
1262 aa  265  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  33.17 
 
 
969 aa  262  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.72 
 
 
1188 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
1443 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.19 
 
 
930 aa  255  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 
1196 aa  251  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.95 
 
 
1474 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.29 
 
 
1247 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.85 
 
 
1609 aa  245  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.42 
 
 
1711 aa  245  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 
1367 aa  240  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.96 
 
 
1213 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 
1229 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.73 
 
 
1686 aa  236  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.44 
 
 
1330 aa  228  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.59 
 
 
1357 aa  228  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.67 
 
 
919 aa  228  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.11 
 
 
1217 aa  228  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.11 
 
 
1583 aa  225  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 
1684 aa  225  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.85 
 
 
505 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 
1807 aa  222  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.52 
 
 
1188 aa  220  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 
1190 aa  218  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.36 
 
 
1617 aa  217  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  33.15 
 
 
1766 aa  215  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.17 
 
 
1760 aa  214  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.44 
 
 
1607 aa  214  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.35 
 
 
1552 aa  214  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.31 
 
 
1901 aa  214  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 
1789 aa  214  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.41 
 
 
1598 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.79 
 
 
1242 aa  212  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.49 
 
 
1626 aa  211  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.74 
 
 
924 aa  211  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 
1161 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 
1161 aa  207  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.12 
 
 
1208 aa  207  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  28.99 
 
 
1427 aa  206  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 
1164 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.48 
 
 
1599 aa  201  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 
1373 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 
1041 aa  199  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.57 
 
 
1656 aa  192  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.06 
 
 
1267 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.46 
 
 
1209 aa  190  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.75 
 
 
1856 aa  189  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.86 
 
 
1214 aa  188  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  26.73 
 
 
1304 aa  188  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.07 
 
 
1623 aa  187  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.47 
 
 
1491 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.96 
 
 
1661 aa  186  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.02 
 
 
1399 aa  184  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.2 
 
 
1240 aa  184  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.89 
 
 
1177 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.54 
 
 
1004 aa  183  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.22 
 
 
1176 aa  184  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.07 
 
 
1039 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
1311 aa  183  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.1 
 
 
1547 aa  182  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  28.52 
 
 
1714 aa  182  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  22.44 
 
 
1097 aa  181  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.96 
 
 
1016 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.62 
 
 
1205 aa  179  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 
1016 aa  178  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.94 
 
 
608 aa  177  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.1 
 
 
1823 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.31 
 
 
1657 aa  175  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 
1190 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.48 
 
 
1858 aa  170  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.19 
 
 
677 aa  168  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.03 
 
 
1344 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.84 
 
 
1209 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  28.34 
 
 
1100 aa  164  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.85 
 
 
676 aa  162  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 
346 aa  162  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.34 
 
 
1411 aa  161  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.73 
 
 
1348 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>